More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0105 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  42.29 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  41.95 
 
 
201 aa  129  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  44.08 
 
 
199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  45.39 
 
 
204 aa  124  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  39.46 
 
 
197 aa  124  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  43.68 
 
 
201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  42.53 
 
 
201 aa  111  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  38.93 
 
 
196 aa  106  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  37.75 
 
 
214 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 
213 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  35.76 
 
 
174 aa  101  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  34.1 
 
 
174 aa  91.7  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 
174 aa  92  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
193 aa  91.7  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  33.52 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  31.15 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  31.15 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
176 aa  88.2  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  31.15 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 
192 aa  88.2  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  33.54 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 
210 aa  85.1  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  33.88 
 
 
211 aa  84.3  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  31.49 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  32.3 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  32.3 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  31.68 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  32.3 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  32.92 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  32.3 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  32.92 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 
231 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 
231 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
230 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  31.68 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  34.1 
 
 
297 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  34.1 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  34.1 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  34.1 
 
 
295 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  33.53 
 
 
295 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  34.1 
 
 
295 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  33.53 
 
 
295 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  34.1 
 
 
295 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  34.1 
 
 
297 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  30.39 
 
 
285 aa  79  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 
231 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  33.53 
 
 
295 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.69 
 
 
278 aa  77.8  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  36.43 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  36.43 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  30.6 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  30.6 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  30.6 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  30.6 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  36.43 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  30.6 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  30.6 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  30.6 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  30.6 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  29.14 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  30.34 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  31.95 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  29.14 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  29.14 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  29.71 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  29.14 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  29.14 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  31.03 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  30.34 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  30.43 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  30.43 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>