More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_4049 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  55.52 
 
 
1047 aa  1161    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.52 
 
 
1047 aa  1162    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  37.73 
 
 
1077 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  52.35 
 
 
1045 aa  1075    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  55.78 
 
 
1070 aa  1125    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  36.52 
 
 
1053 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.71 
 
 
1049 aa  644    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  55.39 
 
 
1052 aa  1124    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  37.55 
 
 
1077 aa  668    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  49.36 
 
 
1091 aa  1024    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  54.52 
 
 
1048 aa  1148    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  70.99 
 
 
1066 aa  1489    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  53.34 
 
 
1045 aa  1128    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  56.68 
 
 
1047 aa  1151    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  36.21 
 
 
1064 aa  643    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  57.05 
 
 
1068 aa  1141    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  52.21 
 
 
1045 aa  1077    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  57.05 
 
 
1052 aa  1157    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  57.05 
 
 
1039 aa  1160    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  52.91 
 
 
1045 aa  1110    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  53.61 
 
 
1045 aa  1113    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  37.46 
 
 
1053 aa  651    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  55.78 
 
 
1070 aa  1125    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  37.45 
 
 
1077 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  51.14 
 
 
1047 aa  1085    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  35.18 
 
 
1049 aa  650    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  35.15 
 
 
1052 aa  649    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  37.52 
 
 
1054 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  50.23 
 
 
1100 aa  1019    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  56.51 
 
 
1040 aa  1150    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  73.71 
 
 
1051 aa  1585    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  71.92 
 
 
1044 aa  1529    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  55.78 
 
 
1070 aa  1125    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  55.78 
 
 
1070 aa  1125    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  73.58 
 
 
1043 aa  1588    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  50.72 
 
 
1046 aa  1022    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  36.15 
 
 
1075 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  36 
 
 
1059 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  56.4 
 
 
1060 aa  1157    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  56.06 
 
 
1039 aa  1118    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  69.26 
 
 
1058 aa  1440    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  56.1 
 
 
1070 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  37.8 
 
 
1077 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  53.4 
 
 
1061 aa  1111    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.73 
 
 
1070 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  56.33 
 
 
1067 aa  1167    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  53.33 
 
 
1074 aa  1091    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  56.3 
 
 
1056 aa  1144    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.78 
 
 
1050 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  56.31 
 
 
1074 aa  1217    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.64 
 
 
1070 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  51.25 
 
 
1045 aa  1084    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  58.37 
 
 
1063 aa  1184    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  56.17 
 
 
1056 aa  1132    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  37.55 
 
 
1077 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  53.15 
 
 
1054 aa  1075    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  55.78 
 
 
1070 aa  1124    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  45.22 
 
 
1015 aa  924    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  56.05 
 
 
1038 aa  1137    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  64.1 
 
 
1059 aa  1387    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  55.78 
 
 
1070 aa  1125    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  53.33 
 
 
1047 aa  1131    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  37.96 
 
 
1077 aa  675    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  52.64 
 
 
1094 aa  1086    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  67.5 
 
 
1051 aa  1402    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  44.73 
 
 
1049 aa  954    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  74.33 
 
 
1043 aa  1609    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  56.7 
 
 
1039 aa  1172    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  53.24 
 
 
1049 aa  1129    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  37.59 
 
 
1054 aa  653    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  55.3 
 
 
1042 aa  1121    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  66.47 
 
 
1052 aa  1408    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  58.16 
 
 
1055 aa  1185    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  35.54 
 
 
1040 aa  647    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  37.55 
 
 
1077 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  58 
 
 
1056 aa  1179    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.35 
 
 
1083 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  36.95 
 
 
1046 aa  646    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  54.95 
 
 
1042 aa  1120    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  53.31 
 
 
1042 aa  1127    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  68.13 
 
 
1043 aa  1439    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  53.34 
 
 
1045 aa  1129    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  74.35 
 
 
1059 aa  1605    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  67.65 
 
 
1060 aa  1427    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  68.79 
 
 
1065 aa  1450    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  56.68 
 
 
1068 aa  1126    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  53.62 
 
 
1048 aa  1105    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  68.19 
 
 
1060 aa  1438    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  53.04 
 
 
1047 aa  1127    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  37.73 
 
 
1077 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  56.75 
 
 
1056 aa  1148    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  53.05 
 
 
1045 aa  1113    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.72 
 
 
1043 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  56.7 
 
 
1055 aa  1173    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  56.33 
 
 
1044 aa  1109    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  56.81 
 
 
1044 aa  1112    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  56.6 
 
 
1047 aa  1143    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.73 
 
 
1070 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  56.68 
 
 
1068 aa  1126    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  52.5 
 
 
1045 aa  1065    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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