More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2254 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  617  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  62.58 
 
 		 312 aa  352  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  63.61 
 
 		 311 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  55.85 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  58.9 
 
 		 306 aa  292  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  32.24 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 288 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  34.7 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  34.33 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  34.89 
 
 		 306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 295 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  32.85 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  33.13 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  31.7 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  33.94 
 
 		 309 aa  99.4  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  32 
 
 		 316 aa  99.4  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  31.65 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  31.51 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  30.46 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  30.91 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  32.27 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  30.16 
 
 		 314 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 283 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0307  transcriptional regulator, LysR family  30.68 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0158849  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 307 aa  92.4  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  33.95 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  29.6 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5520  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  28.82 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>