167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3372 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
190 aa  374  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  62.5 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  56.89 
 
 
187 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  56.29 
 
 
187 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  49.72 
 
 
166 aa  161  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  51.15 
 
 
187 aa  161  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  62.69 
 
 
163 aa  161  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  52.1 
 
 
165 aa  160  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  58.82 
 
 
166 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  59.42 
 
 
161 aa  155  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  55.86 
 
 
279 aa  150  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  61.65 
 
 
160 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  60.14 
 
 
156 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  59.42 
 
 
156 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  61.03 
 
 
160 aa  147  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  61.15 
 
 
157 aa  147  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  48.24 
 
 
178 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  57.04 
 
 
134 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  51.11 
 
 
186 aa  142  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  46.99 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  58.2 
 
 
261 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  58.52 
 
 
141 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  58.65 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  60.15 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  56.3 
 
 
162 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  43.41 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  50.35 
 
 
193 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  51.75 
 
 
191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  48.89 
 
 
220 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  51.05 
 
 
194 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  44.44 
 
 
185 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  48.25 
 
 
195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  47.97 
 
 
202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  45.19 
 
 
558 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  42.39 
 
 
193 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  46.36 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  60.15 
 
 
168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  48.32 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  48.32 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  48.32 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  48.32 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  46 
 
 
238 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  44.97 
 
 
185 aa  124  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  41.88 
 
 
184 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  46.67 
 
 
183 aa  121  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  53.38 
 
 
133 aa  120  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  48.3 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  52.63 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  51.13 
 
 
133 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  41.53 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  46.98 
 
 
185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  46.31 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  46.31 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  45.64 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  40 
 
 
189 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  45.93 
 
 
194 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  44.05 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  44.24 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  48.89 
 
 
139 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  44.3 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  51.52 
 
 
133 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  43.92 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  51.13 
 
 
151 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  51.52 
 
 
133 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  43.42 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  39.86 
 
 
210 aa  105  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  49.59 
 
 
167 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  42.22 
 
 
161 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  47.15 
 
 
164 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  38.97 
 
 
189 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  45.08 
 
 
160 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  45.97 
 
 
201 aa  101  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  37.41 
 
 
192 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  41.8 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  44.37 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  39.55 
 
 
140 aa  95.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  46.4 
 
 
143 aa  94.7  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.35 
 
 
133 aa  94.7  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  39.55 
 
 
202 aa  94.7  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  43.9 
 
 
163 aa  93.2  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  43.9 
 
 
163 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.26 
 
 
308 aa  91.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  44.93 
 
 
142 aa  91.7  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  32.33 
 
 
142 aa  88.6  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  44.35 
 
 
315 aa  88.2  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  37.43 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  41.67 
 
 
229 aa  87.8  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  35.56 
 
 
134 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  32.33 
 
 
141 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  36.42 
 
 
169 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  35.56 
 
 
134 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  42.64 
 
 
226 aa  85.9  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  42.45 
 
 
611 aa  85.5  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  44.26 
 
 
596 aa  85.5  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  41.04 
 
 
215 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  41.73 
 
 
235 aa  84.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  32.59 
 
 
134 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  31.85 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  41.35 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>