More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1107 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  53.95 
 
 
592 aa  640  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  57.67 
 
 
605 aa  708  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 
593 aa  653  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0759  GTP-binding protein TypA  69.35 
 
 
633 aa  870  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00250463  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4040  GTP-binding protein TypA  66.94 
 
 
633 aa  810  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  54.37 
 
 
627 aa  643  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  54.74 
 
 
610 aa  662  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 
610 aa  659  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  55.79 
 
 
616 aa  644  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  52.61 
 
 
614 aa  654  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
614 aa  651  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.78887e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0578  GTP-binding protein TypA  60.1 
 
 
609 aa  697  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0310674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  77.11 
 
 
630 aa  975  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  54.81 
 
 
615 aa  639  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  75.98 
 
 
620 aa  958  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 
613 aa  636  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  54.52 
 
 
608 aa  660  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0793  GTP-binding protein TypA  72.14 
 
 
635 aa  904  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11090  GTP-binding protein TypA/BipA  68.45 
 
 
640 aa  872  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0960389  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  74.56 
 
 
629 aa  965  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  75.72 
 
 
622 aa  962  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  54.81 
 
 
615 aa  639  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31160  GTP-binding protein TypA/BipA  71.11 
 
 
640 aa  879  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  75.99 
 
 
630 aa  960  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11190  GTP-binding translation elongation factor typA  65.41 
 
 
628 aa  786  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
614 aa  651  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  73.23 
 
 
633 aa  919  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4540  GTP-binding protein TypA  66.3 
 
 
634 aa  825  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  75.68 
 
 
641 aa  966  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  54.89 
 
 
616 aa  681  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  54.92 
 
 
605 aa  681  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  69.74 
 
 
642 aa  887  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.92047e-05 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  54.98 
 
 
608 aa  662  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2163  GTP-binding protein TypA  66.77 
 
 
642 aa  810  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  55.07 
 
 
608 aa  647  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  57.7 
 
 
614 aa  707  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.78233e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4115  GTP-binding protein TypA  66.94 
 
 
633 aa  810  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  54.74 
 
 
610 aa  647  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.16376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  54.2 
 
 
613 aa  649  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  54.66 
 
 
612 aa  658  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  52.91 
 
 
615 aa  650  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  68.95 
 
 
642 aa  886  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  58.89 
 
 
594 aa  696  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
614 aa  650  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
614 aa  651  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  71.41 
 
 
636 aa  895  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  53.91 
 
 
613 aa  637  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  74.72 
 
 
631 aa  950  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4269  GTP-binding protein TypA  66.94 
 
 
633 aa  810  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  56.45 
 
 
594 aa  672  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  52.6 
 
 
614 aa  650  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  52.27 
 
 
614 aa  645  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
614 aa  651  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  77.36 
 
 
620 aa  974  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  55.72 
 
 
606 aa  677  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  5.61063e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  59.28 
 
 
608 aa  715  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1268  GTP-binding protein TypA  69.05 
 
 
629 aa  895  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0246  membrane GTPase for stress response  62.05 
 
 
643 aa  798  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.107779  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  58.81 
 
 
608 aa  731  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  80.49 
 
 
650 aa  1009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  71.64 
 
 
620 aa  913  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  54.81 
 
 
615 aa  640  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0962  GTP-binding protein TypA  71.04 
 
 
645 aa  890  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0622618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  82.5 
 
 
617 aa  1059  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
614 aa  651  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0480  GTP-binding protein TypA  62.2 
 
 
641 aa  796  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  52.6 
 
 
614 aa  651  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0987  GTP-binding protein TypA  73.39 
 
 
645 aa  930  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0410239  normal  0.953039 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.21 
 
 
602 aa  655  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.29587e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  79.38 
 
 
630 aa  997  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26090  GTP-binding protein TypA/BipA  70.03 
 
 
636 aa  896  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.876916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  75.36 
 
 
613 aa  945  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  73.53 
 
 
624 aa  925  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
614 aa  651  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  54.95 
 
 
614 aa  651  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  54.33 
 
 
598 aa  636  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  83.72 
 
 
617 aa  1039  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  51.39 
 
 
615 aa  640  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
617 aa  1240  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1144  GTP-binding protein TypA  66.29 
 
 
635 aa  818  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3331  GTP-binding protein TypA  66.51 
 
 
636 aa  827  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  54.49 
 
 
613 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  53.85 
 
 
609 aa  633  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 
614 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  50.89 
 
 
615 aa  630  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  52.5 
 
 
598 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  54.24 
 
 
597 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  54.07 
 
 
597 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  51.22 
 
 
613 aa  629  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  54.24 
 
 
597 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 
603 aa  630  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  50.89 
 
 
615 aa  630  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
612 aa  625  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  52.85 
 
 
601 aa  626  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.65728e-05 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  51.72 
 
 
608 aa  627  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.44002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  54.33 
 
 
605 aa  626  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  52.85 
 
 
601 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 
602 aa  622  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2717  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 
613 aa  622  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 
599 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.75691e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>