More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0043 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  63.05 
 
 		 249 aa  342  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  62.65 
 
 		 249 aa  338  5e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  62.25 
 
 		 249 aa  335  5.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  62.08 
 
 		 244 aa  324  7e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  59.68 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  58.61 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  58.2 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  58.2 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  56.15 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  58.37 
 
 		 250 aa  288  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  49.79 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  50.67 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  50.22 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  50.22 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  49.12 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  47.37 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  49.14 
 
 		 258 aa  211  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  46.46 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  48.93 
 
 		 245 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  48.29 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  45.96 
 
 		 361 aa  208  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  47.58 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  48.46 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  71.85 
 
 		 186 aa  205  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  46.02 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  46.02 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  46.61 
 
 		 356 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  46.96 
 
 		 356 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  46.96 
 
 		 356 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  45.81 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  43.36 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  46.72 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  43.86 
 
 		 345 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  44.12 
 
 		 357 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  43.81 
 
 		 233 aa  188  8e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  43.81 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.12 
 
 		 357 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  38.55 
 
 		 346 aa  184  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  47.16 
 
 		 356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  43.48 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  47.16 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  47.16 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  44.3 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  37.35 
 
 		 346 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  37.61 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  37.61 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  40.09 
 
 		 346 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  36.79 
 
 		 354 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  31.84 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.13 
 
 		 211 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 		 488 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  30.19 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 300 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  30.19 
 
 		 288 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 289 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 300 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  31.23 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  33 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  31.09 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.58 
 
 		 299 aa  99.8  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 489 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.39 
 
 		 292 aa  99  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  28.46 
 
 		 294 aa  98.6  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  35.94 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  33.65 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  30.37 
 
 		 432 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 464 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  29.72 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 294 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.79 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 295 aa  95.9  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  28.25 
 
 		 288 aa  95.9  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.88 
 
 		 207 aa  96.3  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  29.61 
 
 		 218 aa  95.9  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  28.78 
 
 		 294 aa  95.5  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  35.86 
 
 		 213 aa  95.5  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1647  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 		 289 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 		 484 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  30.84 
 
 		 209 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  30.67 
 
 		 471 aa  93.6  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  31.06 
 
 		 431 aa  93.6  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>