235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0008 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  100 
 
 		 380 aa  777    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  28.69 
 
 		 142 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 		 252 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 233 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  35.78 
 
 		 170 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  36.28 
 
 		 164 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  36.46 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  28.79 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  34.51 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  34.34 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  32.74 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 221 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 173 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  32.74 
 
 		 172 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  30.65 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  35.64 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  32.84 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 222 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  36.52 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  30.48 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 227 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 220 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  27.93 
 
 		 144 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  29.27 
 
 		 135 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1543  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 		 140 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  29.27 
 
 		 135 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  29.27 
 
 		 135 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 		 161 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  26.43 
 
 		 133 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  28.87 
 
 		 103 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 140 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  29.57 
 
 		 120 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  28.21 
 
 		 151 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  33.93 
 
 		 114 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 189 aa  54.3  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 226 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 124 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 124 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 		 226 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 112 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 227 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 		 149 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  30.77 
 
 		 137 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  31.68 
 
 		 144 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  31.63 
 
 		 141 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 223 aa  53.5  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  30 
 
 		 423 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  24.06 
 
 		 191 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 177 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  28.81 
 
 		 123 aa  53.5  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  39.34 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 226 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 		 144 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 		 144 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  25.78 
 
 		 129 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 		 149 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  26.56 
 
 		 129 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 		 480 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  29.09 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  33.66 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  33.66 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 		 144 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  30.56 
 
 		 195 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  27.42 
 
 		 148 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  33.66 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>