147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0487 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0472  surface antigen (D15)  98.17 
 
 		 711 aa  1406    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000471704  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0487  surface antigen (D15)  100 
 
 		 711 aa  1425    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00051966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0916  surface antigen  27.79 
 
 		 727 aa  226  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.733535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1228  surface antigen (D15)  25.67 
 
 		 753 aa  198  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0806  surface antigen (D15)  25.3 
 
 		 737 aa  197  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  21.15 
 
 		 781 aa  85.9  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.15 
 
 		 781 aa  85.9  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.31 
 
 		 786 aa  84  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  21.98 
 
 		 763 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.72 
 
 		 763 aa  80.9  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  22.22 
 
 		 893 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  21.25 
 
 		 769 aa  79  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.37 
 
 		 752 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.48 
 
 		 895 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  21.79 
 
 		 896 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  23.18 
 
 		 778 aa  77  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.66 
 
 		 808 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.97 
 
 		 775 aa  75.9  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  23.98 
 
 		 553 aa  74.7  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  23.08 
 
 		 763 aa  73.9  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2601  surface antigen, putative  20.95 
 
 		 818 aa  72.4  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.22 
 
 		 895 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.62 
 
 		 769 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.75 
 
 		 920 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.68 
 
 		 836 aa  67.8  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.91 
 
 		 848 aa  67.4  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  20.89 
 
 		 796 aa  67  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0825  outer membrane protein  23.95 
 
 		 821 aa  65.5  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.860855  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  20.35 
 
 		 806 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.35 
 
 		 793 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  21.52 
 
 		 818 aa  63.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.2 
 
 		 793 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  25.29 
 
 		 900 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.18 
 
 		 758 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  24.87 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  21.18 
 
 		 752 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  21.59 
 
 		 779 aa  62.4  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  22.44 
 
 		 765 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  20.34 
 
 		 780 aa  62.4  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  25.57 
 
 		 777 aa  62  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  20.18 
 
 		 820 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  20.89 
 
 		 770 aa  62  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  21.34 
 
 		 796 aa  61.2  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.29 
 
 		 770 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  20.28 
 
 		 888 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1808  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22 
 
 		 868 aa  59.7  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.06 
 
 		 769 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  19.76 
 
 		 913 aa  59.3  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.41 
 
 		 779 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.76 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  21.97 
 
 		 769 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  21.97 
 
 		 769 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  21.97 
 
 		 768 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  22.22 
 
 		 767 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  21.26 
 
 		 751 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  21.6 
 
 		 791 aa  57.4  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  21.97 
 
 		 768 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  21.02 
 
 		 765 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  20.97 
 
 		 803 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.12 
 
 		 844 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  21.06 
 
 		 769 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.92 
 
 		 800 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.34 
 
 		 770 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.36 
 
 		 784 aa  55.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  20.27 
 
 		 790 aa  55.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  21.24 
 
 		 765 aa  55.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  21.24 
 
 		 769 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.24 
 
 		 765 aa  55.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  20.9 
 
 		 769 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  20.9 
 
 		 769 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  21.24 
 
 		 768 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  21.24 
 
 		 768 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  21.24 
 
 		 768 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.9 
 
 		 769 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2265  surface antigen (D15)  21.83 
 
 		 839 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.64 
 
 		 768 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.46 
 
 		 855 aa  55.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  20.15 
 
 		 768 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  22.43 
 
 		 1002 aa  54.7  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.61 
 
 		 807 aa  54.3  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  21.03 
 
 		 785 aa  54.3  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  20.45 
 
 		 785 aa  54.3  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  21.67 
 
 		 848 aa  54.3  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.13 
 
 		 892 aa  53.9  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.04 
 
 		 765 aa  53.9  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  21.13 
 
 		 772 aa  52.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.92 
 
 		 749 aa  53.1  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0512  outer membrane protein, putative  21.55 
 
 		 792 aa  52.4  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  20.54 
 
 		 788 aa  52.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  32 
 
 		 683 aa  52  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  28.97 
 
 		 739 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  20.35 
 
 		 784 aa  52  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  22.92 
 
 		 601 aa  52  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  28.97 
 
 		 739 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.89 
 
 		 856 aa  52  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  21.79 
 
 		 807 aa  51.6  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  25.61 
 
 		 821 aa  51.6  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.39 
 
 		 854 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.42 
 
 		 769 aa  51.2  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  24.8 
 
 		 838 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>