156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0472 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0472  surface antigen (D15)  100 
 
 
711 aa  1423    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000471704  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0487  surface antigen (D15)  98.17 
 
 
711 aa  1406    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00051966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0916  surface antigen  27.98 
 
 
727 aa  225  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.733535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1228  surface antigen (D15)  25.4 
 
 
753 aa  198  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0806  surface antigen (D15)  25.44 
 
 
737 aa  197  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.09 
 
 
786 aa  89  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  21.15 
 
 
781 aa  85.5  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.15 
 
 
781 aa  85.5  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.09 
 
 
895 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  22.63 
 
 
893 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  21.64 
 
 
769 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  22.66 
 
 
896 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.21 
 
 
808 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  21.89 
 
 
763 aa  80.9  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.27 
 
 
752 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.5 
 
 
763 aa  78.2  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  23.26 
 
 
778 aa  77.4  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.21 
 
 
775 aa  76.3  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  24.18 
 
 
553 aa  75.5  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  22.58 
 
 
763 aa  75.9  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.94 
 
 
895 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.31 
 
 
920 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2601  surface antigen, putative  21.7 
 
 
818 aa  72.8  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  20.52 
 
 
806 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.67 
 
 
793 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  21.32 
 
 
796 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.38 
 
 
793 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.99 
 
 
769 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.56 
 
 
836 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.38 
 
 
848 aa  68.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  20.85 
 
 
780 aa  67  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  20.93 
 
 
770 aa  66.6  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  20.29 
 
 
820 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  21.69 
 
 
779 aa  64.3  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.95 
 
 
758 aa  63.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  25.38 
 
 
560 aa  62.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  21.8 
 
 
818 aa  63.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  25.57 
 
 
777 aa  63.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  19.91 
 
 
913 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0825  outer membrane protein  23.37 
 
 
821 aa  62  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.860855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  20.71 
 
 
765 aa  62  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1808  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.77 
 
 
868 aa  60.8  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  21.38 
 
 
796 aa  60.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  23.22 
 
 
1002 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.32 
 
 
772 aa  60.1  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  21.58 
 
 
751 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.83 
 
 
769 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  20.04 
 
 
765 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  21.6 
 
 
791 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.68 
 
 
800 aa  58.9  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.54 
 
 
855 aa  58.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.55 
 
 
770 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  21.92 
 
 
769 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  21.92 
 
 
768 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  21.92 
 
 
769 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.8 
 
 
768 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  21.92 
 
 
768 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  20.04 
 
 
752 aa  57.4  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  20.55 
 
 
768 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  21.88 
 
 
765 aa  57.4  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  21.03 
 
 
769 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  23.29 
 
 
767 aa  57.4  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  20.83 
 
 
788 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.68 
 
 
784 aa  57.4  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  24.83 
 
 
900 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.88 
 
 
765 aa  57.4  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.51 
 
 
807 aa  56.6  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  20.36 
 
 
790 aa  56.6  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  20.87 
 
 
769 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  20.87 
 
 
769 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.87 
 
 
769 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  22.83 
 
 
760 aa  55.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  21.2 
 
 
768 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  21.2 
 
 
768 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  21.2 
 
 
768 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  21.2 
 
 
769 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.13 
 
 
765 aa  55.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2265  surface antigen (D15)  21.5 
 
 
839 aa  55.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  20.62 
 
 
765 aa  54.7  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  19.54 
 
 
888 aa  55.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.13 
 
 
892 aa  54.7  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.92 
 
 
770 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.13 
 
 
781 aa  54.3  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  21.2 
 
 
785 aa  53.9  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  19.96 
 
 
785 aa  53.9  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.91 
 
 
844 aa  53.9  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.15 
 
 
856 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.55 
 
 
765 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  20.35 
 
 
784 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  21.81 
 
 
772 aa  53.9  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.52 
 
 
854 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.77 
 
 
749 aa  53.9  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.58 
 
 
854 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  20.82 
 
 
781 aa  52.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  21.95 
 
 
766 aa  53.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.6 
 
 
821 aa  52.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  32.67 
 
 
683 aa  53.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.58 
 
 
864 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  29.8 
 
 
739 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  29.8 
 
 
739 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>