67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2845 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  57.04 
 
 		 1000 aa  1011    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  56.07 
 
 		 997 aa  998    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  44.98 
 
 		 980 aa  697    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  100 
 
 		 977 aa  1952    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  56.57 
 
 		 997 aa  1002    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  48.53 
 
 		 988 aa  822    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  47.72 
 
 		 986 aa  805    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  36.19 
 
 		 1001 aa  452  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  34.44 
 
 		 1042 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  34.84 
 
 		 1049 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  33.18 
 
 		 1059 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  32.25 
 
 		 1052 aa  422  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1052 aa  415  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  32.92 
 
 		 1052 aa  415  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  33.08 
 
 		 1064 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  33.52 
 
 		 1064 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  33.11 
 
 		 1048 aa  399  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1049 aa  396  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  34.26 
 
 		 999 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  34.22 
 
 		 1049 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  34.88 
 
 		 1015 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  31.93 
 
 		 1062 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1042 aa  380  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  32.32 
 
 		 991 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  35.31 
 
 		 1037 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  31.39 
 
 		 1047 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  33.14 
 
 		 1047 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  32.61 
 
 		 1045 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  32.64 
 
 		 1047 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  34.79 
 
 		 1018 aa  365  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  33.27 
 
 		 1040 aa  353  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  31.71 
 
 		 1043 aa  351  4e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  33.21 
 
 		 1054 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  33.2 
 
 		 1016 aa  341  5e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  29.47 
 
 		 1076 aa  322  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  31.65 
 
 		 991 aa  317  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  32.81 
 
 		 1014 aa  313  7.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  29.1 
 
 		 993 aa  297  7e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  32.45 
 
 		 959 aa  246  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  36.23 
 
 		 1048 aa  238  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1053 aa  229  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  19.47 
 
 		 911 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  19.34 
 
 		 914 aa  111  7.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  23.71 
 
 		 890 aa  87.8  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  25.38 
 
 		 779 aa  74.3  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  23.81 
 
 		 780 aa  70.5  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  25.07 
 
 		 788 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  25.28 
 
 		 788 aa  68.2  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.48 
 
 		 989 aa  67  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  20.68 
 
 		 803 aa  66.6  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  25.07 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.32 
 
 		 958 aa  63.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  23.48 
 
 		 781 aa  56.6  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  24.02 
 
 		 794 aa  55.5  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.75 
 
 		 1048 aa  52.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  25.23 
 
 		 856 aa  52  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.82 
 
 		 986 aa  51.6  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  24.15 
 
 		 962 aa  50.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  21.08 
 
 		 858 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  23.87 
 
 		 947 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  23.51 
 
 		 976 aa  47.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  23.22 
 
 		 864 aa  46.2  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  21.08 
 
 		 858 aa  46.2  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.1 
 
 		 916 aa  45.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.44 
 
 		 836 aa  45.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  21.19 
 
 		 919 aa  45.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  23.35 
 
 		 984 aa  44.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>