More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0034 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  66.67 
 
 		 251 aa  321  7e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  60.33 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  59.92 
 
 		 253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  59.92 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  59.92 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  59.92 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  58.61 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  58.68 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  58.26 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  58.68 
 
 		 258 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  58.68 
 
 		 246 aa  295  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  59.92 
 
 		 251 aa  294  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  58.7 
 
 		 249 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  60.34 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  59.5 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  59.92 
 
 		 260 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  59.5 
 
 		 260 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  58.26 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  57.49 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  59.92 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  54.66 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  55.87 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  55.37 
 
 		 257 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  55.87 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  55.79 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 254 aa  278  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  54.92 
 
 		 255 aa  278  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  53.47 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  55.79 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  55.37 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  54.84 
 
 		 257 aa  275  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  52.85 
 
 		 258 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  57.55 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  57.61 
 
 		 255 aa  271  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  55.1 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  52.07 
 
 		 247 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  51.24 
 
 		 247 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  54.55 
 
 		 269 aa  234  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  52.91 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  50.43 
 
 		 572 aa  229  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  52.42 
 
 		 238 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  50 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  51.98 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  51.98 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  53.95 
 
 		 246 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  46.91 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  44.58 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1120  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.26 
 
 		 350 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.667973  decreased coverage  0.00637132 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0500  ABC transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 		 328 aa  211  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.53 
 
 		 339 aa  211  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  49.79 
 
 		 234 aa  211  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 		 571 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  44.96 
 
 		 588 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0223  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.52 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  43.53 
 
 		 571 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.34 
 
 		 566 aa  210  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.18 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  47.29 
 
 		 532 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.18 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.81 
 
 		 355 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.18 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.18 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.18 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  46.22 
 
 		 328 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.18 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.18 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.35 
 
 		 368 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.18 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 539 aa  209  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 		 332 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 		 543 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2060  ABC transporter related  56.78 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.558102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  43.78 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.57 
 
 		 676 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0559  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.25 
 
 		 340 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.98385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2803  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.49 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0457  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.44 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0573  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  45.6 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.481261  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.29 
 
 		 564 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4281  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.53 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113055  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0691  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0219399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  48.95 
 
 		 613 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6652  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.09 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>