More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2013 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 1055 aa  2202    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  35.1 
 
 		 700 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  33.24 
 
 		 739 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  31.79 
 
 		 729 aa  362  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  31.01 
 
 		 698 aa  347  6e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  30.34 
 
 		 891 aa  318  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  31.05 
 
 		 777 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  29.07 
 
 		 745 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  31.5 
 
 		 726 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  30 
 
 		 747 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  30.45 
 
 		 692 aa  304  7.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  30.47 
 
 		 807 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  30.25 
 
 		 747 aa  301  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  29.57 
 
 		 744 aa  296  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  28.53 
 
 		 731 aa  290  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  27.9 
 
 		 794 aa  289  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  29.87 
 
 		 685 aa  286  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  30.56 
 
 		 756 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  29.04 
 
 		 791 aa  277  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  30.08 
 
 		 753 aa  274  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  27.49 
 
 		 776 aa  274  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  30.57 
 
 		 1135 aa  272  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  27.36 
 
 		 1148 aa  270  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  30.38 
 
 		 755 aa  261  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  25.57 
 
 		 791 aa  258  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  29.73 
 
 		 711 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  27.31 
 
 		 1139 aa  251  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  28.08 
 
 		 1143 aa  251  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  30.49 
 
 		 759 aa  248  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 		 691 aa  241  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  26.61 
 
 		 691 aa  240  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  26.61 
 
 		 691 aa  240  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  26.61 
 
 		 691 aa  240  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  28.03 
 
 		 694 aa  239  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  27.14 
 
 		 691 aa  238  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 		 691 aa  234  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 		 691 aa  234  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  27.65 
 
 		 731 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 		 691 aa  233  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  28.85 
 
 		 730 aa  231  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  28.97 
 
 		 708 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  28.44 
 
 		 744 aa  228  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  27.82 
 
 		 708 aa  227  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  26.4 
 
 		 692 aa  227  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  25.63 
 
 		 691 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  26.27 
 
 		 691 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  26.14 
 
 		 692 aa  222  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  26.06 
 
 		 692 aa  221  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  26.63 
 
 		 670 aa  220  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.3 
 
 		 685 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 		 727 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  27.82 
 
 		 731 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.87 
 
 		 893 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  25.75 
 
 		 698 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  28.01 
 
 		 750 aa  213  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  25.93 
 
 		 694 aa  212  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  26.27 
 
 		 698 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 		 703 aa  210  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  26.36 
 
 		 698 aa  209  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  28.84 
 
 		 734 aa  209  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  29.01 
 
 		 691 aa  209  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  25.55 
 
 		 688 aa  208  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  26.58 
 
 		 726 aa  207  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.47 
 
 		 726 aa  206  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  26.55 
 
 		 726 aa  206  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  26.37 
 
 		 688 aa  205  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  26.11 
 
 		 732 aa  204  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 		 738 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  26.22 
 
 		 688 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.37 
 
 		 893 aa  203  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  27.15 
 
 		 688 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  29.09 
 
 		 739 aa  202  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  25.98 
 
 		 763 aa  201  5e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  28.75 
 
 		 737 aa  201  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.26 
 
 		 900 aa  201  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  27.34 
 
 		 761 aa  200  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 		 701 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  28.64 
 
 		 668 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  27.62 
 
 		 692 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 		 705 aa  198  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  26.6 
 
 		 754 aa  197  7e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  27.12 
 
 		 731 aa  197  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  25.99 
 
 		 749 aa  197  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  26.49 
 
 		 678 aa  197  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  24.85 
 
 		 666 aa  197  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  26.74 
 
 		 703 aa  196  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.71 
 
 		 893 aa  196  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  26.24 
 
 		 741 aa  195  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  26.33 
 
 		 728 aa  194  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  25.22 
 
 		 669 aa  194  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 		 662 aa  193  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  25.77 
 
 		 756 aa  194  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.47 
 
 		 917 aa  192  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 		 690 aa  193  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  24.82 
 
 		 936 aa  192  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  25.65 
 
 		 698 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  28.13 
 
 		 676 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  26.26 
 
 		 709 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  25.42 
 
 		 718 aa  192  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  25.42 
 
 		 718 aa  192  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>