100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2417 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  100 
 
 		 366 aa  754    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  56.51 
 
 		 363 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  53.98 
 
 		 360 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  38.07 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  34.48 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  32.49 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  30.99 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  30.79 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  29.13 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  27.55 
 
 		 354 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  30.09 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  28.61 
 
 		 383 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  30.16 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  31.74 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  29.92 
 
 		 354 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  28.53 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  39.57 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  45.45 
 
 		 445 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  45.45 
 
 		 445 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  28 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  29.23 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  28.4 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  29.85 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  30.5 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  31.83 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  29.79 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  27.67 
 
 		 357 aa  126  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  34.55 
 
 		 421 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  34.55 
 
 		 421 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  30.47 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  36.32 
 
 		 352 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  32.02 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  28.01 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  35.39 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  27.58 
 
 		 347 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  27.02 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  24.78 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  25.08 
 
 		 346 aa  92.8  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  25 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  25 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  24.32 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  24.32 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  26.4 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  24.45 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  26.49 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  35.05 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  36.84 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.44 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  25.89 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  35.92 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  35.92 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  24.59 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  23.44 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  25 
 
 		 396 aa  72  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  33.94 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  22.98 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  29.1 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  31.91 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  31.91 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  24.11 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  28.32 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  25 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  24.32 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  22.15 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  22.95 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  27.11 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  21.74 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  24.05 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  22.87 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.31 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  23.91 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  25.31 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  31.76 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  26.7 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  25.26 
 
 		 348 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  25.95 
 
 		 363 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  24.56 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  21.78 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  23.56 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  23.98 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1349  beta-lactam resistance factor  24.54 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.620165  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  32.18 
 
 		 426 aa  46.6  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  21.99 
 
 		 753 aa  46.2  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  22.4 
 
 		 333 aa  46.2  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  21.75 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  26.73 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1327  hypothetical protein  25.28 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0362501 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.84 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  26.09 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  24.86 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0508  beta-lactam resistance factor  27.55 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0830649  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  25.56 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  23.68 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  23.15 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4359  hypothetical protein  20.06 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0644  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  28.95 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  21.02 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  24.34 
 
 		 331 aa  43.1  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  39.22 
 
 		 437 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>