More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  34.74 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  34.53 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  37.86 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  36.84 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 306 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 305 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  33.23 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  34.42 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  36.33 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  35.83 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 294 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  33.66 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  34.97 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  36.4 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 319 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  32.69 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2363  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2123  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000012035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  32.91 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4305  LysR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.201551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  31.25 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3612  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  33.57 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>