More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1568 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  100 
 
 		 317 aa  654    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  45.55 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  41.8 
 
 		 300 aa  249  6e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  40.68 
 
 		 316 aa  248  9e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  41.48 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  43.2 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  39.4 
 
 		 319 aa  222  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  39.18 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  37.58 
 
 		 313 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  36.09 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  36.49 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  43.52 
 
 		 268 aa  195  7e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  37.16 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  37.5 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  32.52 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  34.85 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  35.74 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  48.48 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1544  peptidase M23B  34.78 
 
 		 336 aa  158  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  31.44 
 
 		 262 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  32.17 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  39.47 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  45.45 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  32.9 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  39.78 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  34.98 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  37.29 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  37.28 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  38.37 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  34.8 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  44.53 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  47.11 
 
 		 375 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  44.96 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  44.09 
 
 		 223 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  47.01 
 
 		 247 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  40.82 
 
 		 229 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  44 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  36.36 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  38.12 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  39.89 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  40.74 
 
 		 248 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  33.33 
 
 		 374 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  27.88 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.29 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  36.69 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  36.65 
 
 		 442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  29.14 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  36.78 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  28.82 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  30.24 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  41.03 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  31.25 
 
 		 305 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  38.89 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  42.97 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  42.54 
 
 		 442 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  30.13 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  44.63 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  33.84 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  39.87 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  38.76 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  32.85 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  38.76 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  39.2 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  43.22 
 
 		 271 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  38.64 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  43.22 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  38.78 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  42.37 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  43.65 
 
 		 453 aa  106  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  48.11 
 
 		 582 aa  106  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  42.19 
 
 		 656 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  35.1 
 
 		 423 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  36.26 
 
 		 309 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  38.76 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  32.5 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  34.71 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  41.07 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  42.06 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  41.18 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  34.71 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  42.74 
 
 		 468 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  32.11 
 
 		 404 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  38.46 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  39.04 
 
 		 491 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  39.83 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  30.09 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  42.98 
 
 		 429 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  44.26 
 
 		 491 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  45.61 
 
 		 464 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.9 
 
 		 454 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  37.11 
 
 		 414 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  47.79 
 
 		 448 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  38.56 
 
 		 459 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  30.53 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  39.84 
 
 		 577 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  42.86 
 
 		 527 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  33.9 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  45.61 
 
 		 464 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  31.65 
 
 		 441 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>