More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1496 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  100 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  98.65 
 
 		 222 aa  428  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.14 
 
 		 223 aa  311  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  74.19 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.72 
 
 		 220 aa  279  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.62 
 
 		 225 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  64.98 
 
 		 217 aa  272  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.36 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  63.59 
 
 		 217 aa  268  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.98 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.52 
 
 		 217 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  64.32 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  61.97 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  64.06 
 
 		 218 aa  258  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.67 
 
 		 217 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  62.33 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  61.75 
 
 		 219 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.29 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.47 
 
 		 218 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.68 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.26 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.72 
 
 		 218 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  60 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.76 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.5 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.92 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.17 
 
 		 234 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  58.06 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  58.18 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  52.31 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.84 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.92 
 
 		 227 aa  202  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.3 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.27 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.53 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  53.46 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  52.07 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.45 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  53 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.85 
 
 		 218 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.02 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  47.49 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.49 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  49.78 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 227 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.03 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.86 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.51 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.12 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.03 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  46.82 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  49.12 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  44.29 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.29 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.29 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.29 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 283 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.66 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.84 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.89 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  44.29 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 238 aa  175  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.95 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.84 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  47.73 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.12 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  44.29 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1127  heavy metal response regulator  44.89 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  44.29 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00315  probable two component response regulator transcription regulator protein  43.89 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 236 aa  171  9e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  44.64 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  42.11 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  43.69 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>