99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1187 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  77.19 
 
 
789 aa  1297  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  100 
 
 
778 aa  1624  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  77.44 
 
 
789 aa  1301  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  77.16 
 
 
788 aa  1300  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  78.17 
 
 
788 aa  1311  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  33.89 
 
 
822 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  33.57 
 
 
833 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  33.56 
 
 
843 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  8.08171e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  25.73 
 
 
729 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  25.92 
 
 
730 aa  186  2e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  25.95 
 
 
724 aa  184  5e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.33685e-05  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  25.79 
 
 
730 aa  184  5e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.52412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  26.05 
 
 
730 aa  184  5e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.96014e-05  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  26.62 
 
 
725 aa  184  5e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  25.97 
 
 
745 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  25.47 
 
 
719 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  35.96 
 
 
724 aa  181  6e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  25.46 
 
 
727 aa  179  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  26.18 
 
 
731 aa  176  1e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.84393e-06  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  31.52 
 
 
735 aa  173  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  33.9 
 
 
731 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  25.47 
 
 
720 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  29.27 
 
 
741 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  4.2193e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  24.44 
 
 
738 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  23.86 
 
 
722 aa  158  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  24.13 
 
 
826 aa  138  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  24.62 
 
 
742 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  25.26 
 
 
742 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  24.49 
 
 
742 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  23.34 
 
 
782 aa  115  2e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  23.73 
 
 
758 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  24.13 
 
 
762 aa  115  4e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  7.40819e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  24.71 
 
 
761 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.82 
 
 
761 aa  111  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.74 
 
 
764 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  8.91097e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.74 
 
 
764 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  24.08 
 
 
762 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  6.43351e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  23.87 
 
 
757 aa  107  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  23.3 
 
 
716 aa  106  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.2 
 
 
762 aa  104  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  24.95 
 
 
945 aa  104  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  23.84 
 
 
741 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  24.84 
 
 
770 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.64 
 
 
764 aa  99  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  25.44 
 
 
640 aa  95.9  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  25.62 
 
 
745 aa  94.7  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  23.45 
 
 
766 aa  91.3  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  23.42 
 
 
639 aa  90.9  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  21.62 
 
 
893 aa  90.5  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  25.43 
 
 
754 aa  89.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  22 
 
 
729 aa  87.8  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  2.80036e-08 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  24.4 
 
 
820 aa  85.9  2e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  23.52 
 
 
639 aa  84.3  8e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  24.09 
 
 
755 aa  84  1e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  24.97 
 
 
639 aa  83.6  1e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  26.18 
 
 
885 aa  83.2  2e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  23.07 
 
 
639 aa  82  4e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.58979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  30.36 
 
 
657 aa  80.1  2e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  24.48 
 
 
898 aa  80.1  2e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  24.56 
 
 
895 aa  79  3e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  23.03 
 
 
639 aa  78.6  5e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  4.44921e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  30.64 
 
 
809 aa  77.8  7e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  22.79 
 
 
639 aa  77  1e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  26.01 
 
 
898 aa  77  1e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  32.42 
 
 
680 aa  75.9  2e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  26.01 
 
 
898 aa  75.9  3e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  22.82 
 
 
765 aa  75.9  3e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  22.65 
 
 
714 aa  75.5  4e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  4.68411e-07 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  22.57 
 
 
639 aa  74.7  5e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  22.69 
 
 
639 aa  74.7  6e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  24.79 
 
 
936 aa  74.7  6e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  23.05 
 
 
639 aa  73.9  1e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  28.24 
 
 
762 aa  73.6  1e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  33.51 
 
 
642 aa  72.8  3e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  33.33 
 
 
700 aa  71.2  6e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  32.04 
 
 
677 aa  69.7  2e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  29.9 
 
 
696 aa  68.2  6e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  22.66 
 
 
764 aa  67  1e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  29.38 
 
 
696 aa  66.2  2e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  23.35 
 
 
639 aa  65.9  3e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  30.28 
 
 
687 aa  65.1  5e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.3 
 
 
731 aa  64.7  6e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  23.97 
 
 
646 aa  64.3  8e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  30.98 
 
 
701 aa  62.8  2e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  30.98 
 
 
701 aa  62.8  2e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  30.98 
 
 
698 aa  63.2  2e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  30.98 
 
 
701 aa  62.8  2e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  30.37 
 
 
655 aa  58.2  5e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  25.14 
 
 
650 aa  57  1e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  21.73 
 
 
650 aa  56.2  2e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.05402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  22.59 
 
 
671 aa  56.6  2e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  21.46 
 
 
650 aa  55.5  4e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.35795e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  22.54 
 
 
671 aa  54.7  7e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  24.72 
 
 
650 aa  54.3  8e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  34.09 
 
 
612 aa  54.3  9e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  24.58 
 
 
650 aa  53.1  2e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  7.31399e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  23.65 
 
 
650 aa  53.1  2e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  22.17 
 
 
663 aa  49.3  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.54716e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  22.32 
 
 
816 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>