More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2151 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  100 
 
 
403 aa  828    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  56.08 
 
 
402 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  55.83 
 
 
402 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  55.83 
 
 
402 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  56.44 
 
 
402 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  56.58 
 
 
402 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  43.22 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  34.26 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  34.48 
 
 
389 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  32.88 
 
 
380 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  32.59 
 
 
388 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  34.8 
 
 
388 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 
382 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  35.37 
 
 
391 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  33.99 
 
 
389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  34.4 
 
 
388 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
382 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  35.44 
 
 
385 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
382 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.15 
 
 
385 aa  184  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  34.68 
 
 
385 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  32.58 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  35.03 
 
 
381 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  31.93 
 
 
388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  31.93 
 
 
388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  31.93 
 
 
388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  32.5 
 
 
389 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 
382 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  32 
 
 
391 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  31.39 
 
 
390 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  34 
 
 
402 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  31.87 
 
 
385 aa  176  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 
388 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  31.23 
 
 
389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  33.5 
 
 
402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  33.09 
 
 
387 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 
390 aa  172  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  32.51 
 
 
390 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  33.6 
 
 
383 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  32.32 
 
 
385 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  33 
 
 
393 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  30.75 
 
 
380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  33.78 
 
 
391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  30.47 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  37.55 
 
 
394 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  32.5 
 
 
403 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.16 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  30.4 
 
 
383 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  32.18 
 
 
383 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  30.05 
 
 
383 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  29.9 
 
 
383 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  30.71 
 
 
383 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  29.73 
 
 
381 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  32.4 
 
 
390 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  32.92 
 
 
388 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  30.83 
 
 
379 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  30.58 
 
 
381 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  34.18 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  27.79 
 
 
388 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.73 
 
 
383 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  30.81 
 
 
384 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  32.15 
 
 
382 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  31.33 
 
 
390 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.46 
 
 
389 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  32.65 
 
 
390 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  30.43 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  32.43 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  30.47 
 
 
404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.08 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  30.79 
 
 
378 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.84 
 
 
382 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  30.55 
 
 
394 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  30.02 
 
 
379 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  29.78 
 
 
379 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  31.78 
 
 
391 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  29.55 
 
 
379 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.73 
 
 
387 aa  142  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  31.44 
 
 
390 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  31.82 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  30.29 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  30.35 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  31.71 
 
 
390 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.1 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.1 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  31.55 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  29.21 
 
 
388 aa  138  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  29.56 
 
 
384 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.1 
 
 
388 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  30.33 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  29 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.3 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.84 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.84 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  30.5 
 
 
390 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.25 
 
 
388 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.25 
 
 
388 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.25 
 
 
388 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  32.26 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.11 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  31.85 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>