More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2943 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
410 aa  841    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.11 
 
 
406 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3860  DNA polymerase III epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease-like protein  45.79 
 
 
407 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3810  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  41.58 
 
 
405 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.18 
 
 
547 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0714  exonuclease  32.34 
 
 
516 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.21 
 
 
204 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1624  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.69 
 
 
298 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00188166  normal  0.266938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  39.27 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  38.74 
 
 
330 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  38.74 
 
 
330 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7047  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  50.35 
 
 
382 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  37.95 
 
 
345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  37.44 
 
 
333 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  38.89 
 
 
389 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  34.15 
 
 
611 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.9 
 
 
224 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9062  DNA-directed DNA polymerase  36 
 
 
189 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13743  DNA polymerase III subunit epsilon  36.41 
 
 
329 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000832595  normal  0.511972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0436  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.9 
 
 
339 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0464133  normal  0.956681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.7 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.21 
 
 
231 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.07 
 
 
232 aa  97.1  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.27 
 
 
463 aa  93.6  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.86 
 
 
180 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.4 
 
 
238 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.5 
 
 
449 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2347  exonuclease  35.12 
 
 
313 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  35.44 
 
 
238 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  36.97 
 
 
457 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  40.61 
 
 
954 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.36 
 
 
237 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.73 
 
 
590 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.81 
 
 
236 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.16 
 
 
459 aa  87  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.48 
 
 
225 aa  86.7  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.66 
 
 
453 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.96 
 
 
236 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.38 
 
 
235 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4141  DNA polymerase III subunit epsilon  35.19 
 
 
252 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1724  DNA polymerase III subunit epsilon  35.19 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  35.29 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.02 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  34.12 
 
 
244 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.99 
 
 
228 aa  84  0.000000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.36 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.35 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.48 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  36.48 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  34.12 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  34.12 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3713  DNA polymerase III subunit epsilon  33.95 
 
 
252 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687255  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  36.69 
 
 
720 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  34.12 
 
 
244 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.78 
 
 
235 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.08 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  34.71 
 
 
241 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.37 
 
 
565 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.28 
 
 
231 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.14 
 
 
921 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  33.89 
 
 
1444 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  35.47 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.4 
 
 
462 aa  82  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2184  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.09 
 
 
234 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0859486  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  33.89 
 
 
1435 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.98 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.35 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  33.53 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0720  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.22 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.387284  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1027  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.12 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.134047  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  33.33 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.22 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  31.46 
 
 
970 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  31.46 
 
 
1433 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  31.46 
 
 
1433 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  31.46 
 
 
1433 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  31.46 
 
 
1433 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  31.46 
 
 
1433 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_002978  WD0108  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.38 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.223432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  31.46 
 
 
1433 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  31.46 
 
 
1433 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  31.46 
 
 
1433 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  31.46 
 
 
1433 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  33.53 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  33.96 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  33.96 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.75 
 
 
456 aa  79.7  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.29 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.81 
 
 
769 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.29 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.74 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  33.53 
 
 
244 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000436585  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 
239 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  34.57 
 
 
252 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.07 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.44 
 
 
235 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.94 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.96 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>