More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5881 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 502 aa  1003    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  85.8 
 
 		 507 aa  880    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  83.73 
 
 		 510 aa  862    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  83.2 
 
 		 516 aa  855    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1982  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  70.87 
 
 		 262 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0214006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1981  ABC transporter related  74.9 
 
 		 260 aa  353  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.65 
 
 		 506 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5760  ABC transporter related  63.87 
 
 		 247 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5384  ABC transporter related  63.45 
 
 		 247 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.773344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5473  ABC transporter related  63.45 
 
 		 247 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.19 
 
 		 595 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  63.45 
 
 		 243 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.12 
 
 		 602 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  60.74 
 
 		 245 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.04 
 
 		 619 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3865  ABC transporter related protein  62.18 
 
 		 249 aa  294  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6047  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.07 
 
 		 598 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166994  normal  0.759317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.33 
 
 		 581 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2483  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.53 
 
 		 254 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000249408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.24 
 
 		 597 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  61.34 
 
 		 243 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  37.68 
 
 		 597 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.82 
 
 		 594 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.68 
 
 		 597 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.11 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0229896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6339  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.19 
 
 		 265 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.68 
 
 		 592 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.85 
 
 		 595 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.18 
 
 		 594 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5383  amino acid ABC transporter permease  60.68 
 
 		 591 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0606283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5472  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.68 
 
 		 591 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.693793  normal  0.393619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5759  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.68 
 
 		 591 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 		 500 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3866  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.13 
 
 		 582 aa  277  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.22 
 
 		 500 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  0.451936 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.74 
 
 		 240 aa  276  8e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 		 598 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.39 
 
 		 246 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.79 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.36 
 
 		 543 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.406316  normal  0.927008 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  54.73 
 
 		 247 aa  270  5.9999999999999995e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 242 aa  269  8.999999999999999e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.74 
 
 		 244 aa  269  8.999999999999999e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  58.16 
 
 		 243 aa  269  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.92 
 
 		 510 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  58.7 
 
 		 248 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4083  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.04 
 
 		 500 aa  267  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.33 
 
 		 510 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 		 502 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  53.97 
 
 		 241 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  53.97 
 
 		 241 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 242 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  53.97 
 
 		 241 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  56.12 
 
 		 242 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 		 241 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.23 
 
 		 240 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.36 
 
 		 239 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 251 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  55.65 
 
 		 244 aa  262  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 		 242 aa  262  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.12 
 
 		 242 aa  262  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  53.2 
 
 		 259 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  52.72 
 
 		 249 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  54.01 
 
 		 255 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  57.08 
 
 		 256 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.39 
 
 		 242 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  56.09 
 
 		 273 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.92 
 
 		 246 aa  261  3e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  57.02 
 
 		 243 aa  261  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.39 
 
 		 244 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  53.33 
 
 		 246 aa  260  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  53.14 
 
 		 240 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  52.72 
 
 		 249 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.39 
 
 		 244 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 240 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 240 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 240 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  51.61 
 
 		 255 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 240 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 240 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  53.75 
 
 		 246 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  56.73 
 
 		 265 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 		 240 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  54.96 
 
 		 244 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  56.54 
 
 		 252 aa  259  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 253 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.51 
 
 		 240 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.78 
 
 		 244 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.49 
 
 		 240 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  53.56 
 
 		 241 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.07 
 
 		 567 aa  258  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 240 aa  257  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.56 
 
 		 247 aa  257  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  56.9 
 
 		 243 aa  257  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 240 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  53.14 
 
 		 260 aa  257  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.28 
 
 		 249 aa  257  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  49.8 
 
 		 269 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  54.77 
 
 		 257 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.97 
 
 		 567 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>