More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3865 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3865  ABC transporter related protein  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  74.79 
 
 		 245 aa  367  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  74.58 
 
 		 243 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5760  ABC transporter related  71.08 
 
 		 247 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5384  ABC transporter related  70.68 
 
 		 247 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.773344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5473  ABC transporter related  70.68 
 
 		 247 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  72.5 
 
 		 243 aa  358  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  63.03 
 
 		 507 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.18 
 
 		 502 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.92 
 
 		 516 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.21 
 
 		 510 aa  291  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1981  ABC transporter related  63.87 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308178  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  57.63 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  59.4 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.62 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  56.36 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.12 
 
 		 240 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  58.9 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 		 269 aa  268  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.12 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  59.32 
 
 		 243 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  55.08 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  55.08 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.71 
 
 		 240 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.26 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  54.89 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  55.51 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  55.51 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.87 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  55.93 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  55.51 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  55.74 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  55.51 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  56.47 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  55.08 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.88 
 
 		 239 aa  265  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  56.36 
 
 		 244 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.56 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  56.41 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  58.7 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  55.08 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  57.32 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.78 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  54.27 
 
 		 253 aa  261  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.04 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  50.41 
 
 		 269 aa  261  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  52.42 
 
 		 273 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.6 
 
 		 249 aa  261  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.32 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  51.41 
 
 		 267 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.23 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  53.47 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 242 aa  258  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  51.04 
 
 		 258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  57.69 
 
 		 243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  51.04 
 
 		 258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  51.82 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  55.51 
 
 		 247 aa  258  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  57.63 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  52.12 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  52.28 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  53.39 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  55.37 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  54.7 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  51.91 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.7 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  54.01 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  54.35 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.14 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  53.39 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  53.39 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  53.91 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.6 
 
 		 246 aa  255  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.41 
 
 		 244 aa  255  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  56.6 
 
 		 246 aa  255  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  54.43 
 
 		 245 aa  254  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 		 244 aa  254  7e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  57.21 
 
 		 248 aa  254  8e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  49.79 
 
 		 263 aa  254  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  51.88 
 
 		 246 aa  254  9e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  55.51 
 
 		 286 aa  253  1.0000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.89 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  49.59 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  53.04 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.16 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  50.85 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  50.2 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  50.21 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  51.49 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  53.42 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  56.6 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4002  ABC transporter related  53.85 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  53.94 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.08 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>