More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4957 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 330 aa  680    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  67.68 
 
 		 341 aa  487  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  60.06 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  54.81 
 
 		 329 aa  340  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  55.95 
 
 		 329 aa  335  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  55.63 
 
 		 329 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  52.44 
 
 		 339 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  43.67 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  42.77 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  43.18 
 
 		 355 aa  235  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  34.28 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  33.76 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 		 355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  30.65 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 368 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 		 352 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  29.62 
 
 		 340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  30.83 
 
 		 822 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.7 
 
 		 337 aa  92.8  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  22.4 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.32 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  29.27 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  29.47 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.2 
 
 		 1099 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  26.83 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  22.49 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  27.04 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 1124 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 		 1101 aa  63.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  26.35 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.81 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  22.77 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  30.69 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0793  putative GAF sensor protein  32.77 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382776  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  23.79 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0979  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 226 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 		 340 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0704  polyprenyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.21 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0808  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.21 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  24.48 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  24.48 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4448  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.62 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.64 
 
 		 264 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.33 
 
 		 789 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.33 
 
 		 789 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.33 
 
 		 789 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.61 
 
 		 441 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 441 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.27 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.61 
 
 		 441 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.61 
 
 		 441 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.61 
 
 		 441 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.61 
 
 		 412 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  24.48 
 
 		 423 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  25.87 
 
 		 439 aa  52.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.61 
 
 		 412 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 322 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 		 397 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  24.49 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 584 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1615  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.22 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  24.49 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  24.49 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  24.22 
 
 		 752 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  25.64 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  28.42 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>