More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3832 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 302 aa  609  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  43.62 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  43.62 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  43.62 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  43.62 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  43.26 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  43.79 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  42.91 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  42.91 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  42.91 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  42.91 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  42.91 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  42.91 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  42.91 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  42.91 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  42.55 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  33.68 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  33.68 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  33.8 
 
 		 292 aa  181  9.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  33.33 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  32.98 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  34.83 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  36.03 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  33.46 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3485  dihydrodipicolinate synthetase  30.69 
 
 		 289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  31.14 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  32.33 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  32.33 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  30.45 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  27.97 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  31.49 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  26.67 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  29.21 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  29.5 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.1 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  30 
 
 		 294 aa  126  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  29.89 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  33.2 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  31.88 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  31.4 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  28.52 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 290 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  30.51 
 
 		 305 aa  125  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  30.29 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  32.01 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  31 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  30.41 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  30.5 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  26.39 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  26.39 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  32.27 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  32.2 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  32.08 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  30.27 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  26.39 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>