More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3874 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  64.5 
 
 
533 aa  635  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  100 
 
 
508 aa  1029  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  55.72 
 
 
511 aa  544  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  55.7 
 
 
513 aa  537  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  35.23 
 
 
519 aa  253  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  33.54 
 
 
539 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  33.99 
 
 
480 aa  240  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  33.63 
 
 
535 aa  239  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  33.63 
 
 
535 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  33.41 
 
 
539 aa  235  1e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  4.58817e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  35.32 
 
 
507 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  33.26 
 
 
527 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  32.72 
 
 
533 aa  227  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  32.65 
 
 
532 aa  227  5e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  32.32 
 
 
540 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  38.75 
 
 
502 aa  226  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  34.17 
 
 
517 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  32.74 
 
 
545 aa  222  1e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  32.11 
 
 
549 aa  221  2e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  32.11 
 
 
538 aa  220  4e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  30.67 
 
 
546 aa  214  3e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  31.42 
 
 
521 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  32.9 
 
 
670 aa  176  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  30.88 
 
 
669 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  30.66 
 
 
688 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.78424e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  30.35 
 
 
693 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  33.26 
 
 
675 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 
503 aa  135  2e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
480 aa  132  2e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  27.03 
 
 
668 aa  123  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  29.67 
 
 
515 aa  119  1e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  29.32 
 
 
656 aa  116  1e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  25.6 
 
 
475 aa  113  1e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  24.94 
 
 
645 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  23.5 
 
 
477 aa  110  4e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  27.56 
 
 
521 aa  110  4e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  23.81 
 
 
485 aa  110  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  27.84 
 
 
495 aa  110  8e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  25.56 
 
 
680 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  27.69 
 
 
520 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  27.18 
 
 
511 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  27.18 
 
 
511 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  27.18 
 
 
511 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  26.68 
 
 
514 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  28.09 
 
 
515 aa  104  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  25.72 
 
 
476 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  27.11 
 
 
612 aa  103  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  27.05 
 
 
541 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  27.94 
 
 
524 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  26.33 
 
 
506 aa  101  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  27 
 
 
525 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  27.29 
 
 
521 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  23.81 
 
 
499 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
489 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  25.68 
 
 
506 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  25.21 
 
 
524 aa  96.7  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  25.33 
 
 
507 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  32.8 
 
 
740 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  26.53 
 
 
537 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  27.63 
 
 
516 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  26.31 
 
 
508 aa  94.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  26.15 
 
 
546 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  27.49 
 
 
535 aa  93.2  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  27.27 
 
 
495 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
484 aa  93.2  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  29.61 
 
 
521 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  26.79 
 
 
540 aa  90.9  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  25.06 
 
 
500 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  27.07 
 
 
485 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  27.59 
 
 
547 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  24.02 
 
 
522 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
505 aa  86.7  1e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  30.6 
 
 
750 aa  86.3  1e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  31.28 
 
 
499 aa  85.9  2e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.95 
 
 
505 aa  85.1  3e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  28.11 
 
 
504 aa  84  6e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  33.16 
 
 
527 aa  84  6e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  28.38 
 
 
515 aa  83.2  1e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  31.25 
 
 
505 aa  82  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  24.37 
 
 
532 aa  81.3  3e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  30.63 
 
 
505 aa  80.1  8e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  2.58971e-05  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  25.7 
 
 
504 aa  79.3  1e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  32.89 
 
 
533 aa  79.3  2e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  32.89 
 
 
508 aa  79.3  2e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  31.19 
 
 
538 aa  79.3  2e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  3.17549e-05  decreased coverage  1.57542e-05 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  25.35 
 
 
523 aa  79.3  2e-13  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  32.89 
 
 
508 aa  79.3  2e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  28.57 
 
 
527 aa  78.6  3e-13  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  25.47 
 
 
532 aa  78.2  3e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  31.4 
 
 
300 aa  77.4  5e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  29.34 
 
 
505 aa  77.4  6e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  26.34 
 
 
542 aa  77  6e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  33.16 
 
 
571 aa  76.6  1e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  30.53 
 
 
564 aa  76.3  1e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  31.03 
 
 
597 aa  75.5  2e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  28.65 
 
 
494 aa  75.1  3e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  30.4 
 
 
551 aa  75.1  3e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  28.31 
 
 
517 aa  74.7  4e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  32.3 
 
 
504 aa  74.3  5e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  32.82 
 
 
542 aa  74.3  5e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>