More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1705 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5812  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.61 
 
 		 299 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.3 
 
 		 299 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.3 
 
 		 299 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2693  putative short chain oxidoreductase  67.91 
 
 		 299 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.28 
 
 		 299 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.58 
 
 		 297 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.335118 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.27 
 
 		 299 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.37 
 
 		 300 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0553918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.18 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.69 
 
 		 308 aa  340  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.23 
 
 		 299 aa  335  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.02 
 
 		 308 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.27 
 
 		 302 aa  322  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3013  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  52.54 
 
 		 321 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.23 
 
 		 201 aa  195  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 307 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0965696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 285 aa  155  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.387596  hitchhiker  0.000782233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.1 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 268 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.93 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  30.27 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.11 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  32.6 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 287 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.62 
 
 		 280 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 268 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 268 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  29.22 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.3 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  34.13 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  27.76 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.76 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  32.38 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  31.05 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 		 280 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  28.4 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.22 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.47 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  31.91 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 271 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 272 aa  96.3  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>