More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5973 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  100 
 
 		 703 aa  1447    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  57.02 
 
 		 674 aa  759    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  43.81 
 
 		 653 aa  592  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  43.79 
 
 		 640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  43.89 
 
 		 660 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  39 
 
 		 662 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  48.21 
 
 		 704 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  50.44 
 
 		 656 aa  484  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  49.34 
 
 		 657 aa  464  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  38.46 
 
 		 673 aa  461  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  44.39 
 
 		 619 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  39.87 
 
 		 599 aa  353  5e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  40.13 
 
 		 601 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  40.09 
 
 		 595 aa  335  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  38.2 
 
 		 587 aa  332  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  40.72 
 
 		 598 aa  329  8e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.38 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  41.51 
 
 		 632 aa  321  3e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  39.23 
 
 		 655 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.47 
 
 		 600 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 604 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.21 
 
 		 582 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  37.5 
 
 		 571 aa  317  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  37.5 
 
 		 598 aa  317  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  37.5 
 
 		 598 aa  317  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  37.5 
 
 		 598 aa  317  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  37.5 
 
 		 598 aa  317  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  37.5 
 
 		 598 aa  317  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  37.5 
 
 		 598 aa  317  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  37.5 
 
 		 598 aa  316  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  38.67 
 
 		 652 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  38.31 
 
 		 632 aa  315  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.1 
 
 		 614 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  39.13 
 
 		 660 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  38.9 
 
 		 660 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  39.13 
 
 		 660 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  37.5 
 
 		 598 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  38.67 
 
 		 651 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  38.9 
 
 		 660 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  37.11 
 
 		 600 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  36.05 
 
 		 660 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  39.14 
 
 		 663 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.25 
 
 		 613 aa  313  9e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  35.88 
 
 		 626 aa  313  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.73 
 
 		 583 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  39.14 
 
 		 664 aa  312  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.83 
 
 		 598 aa  311  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  37.88 
 
 		 604 aa  310  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  36.88 
 
 		 599 aa  310  8e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  38.22 
 
 		 663 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  42.19 
 
 		 587 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  37.1 
 
 		 636 aa  306  7e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  38.14 
 
 		 630 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  37.97 
 
 		 631 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  38.81 
 
 		 633 aa  303  8.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.23 
 
 		 638 aa  303  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  36.15 
 
 		 601 aa  301  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  36.85 
 
 		 660 aa  299  9e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  37.44 
 
 		 582 aa  297  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  37.44 
 
 		 582 aa  297  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  37.44 
 
 		 582 aa  297  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  35.58 
 
 		 684 aa  297  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  39.91 
 
 		 604 aa  296  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  41.82 
 
 		 656 aa  296  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  35.39 
 
 		 666 aa  296  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.36 
 
 		 605 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  35.96 
 
 		 676 aa  295  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  37.22 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  35.54 
 
 		 585 aa  294  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  36.82 
 
 		 686 aa  294  4e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  34.68 
 
 		 598 aa  293  5e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  37.76 
 
 		 578 aa  293  5e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  37.31 
 
 		 584 aa  293  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  39.68 
 
 		 645 aa  293  8e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  37.22 
 
 		 584 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  37.31 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  35.45 
 
 		 601 aa  291  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  34.77 
 
 		 605 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  34.77 
 
 		 605 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  40.11 
 
 		 609 aa  290  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  39.52 
 
 		 576 aa  290  7e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  37.28 
 
 		 617 aa  289  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  37.14 
 
 		 659 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  41.02 
 
 		 584 aa  289  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  34.96 
 
 		 574 aa  287  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.16 
 
 		 588 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  36.83 
 
 		 581 aa  286  9e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  31.02 
 
 		 584 aa  286  9e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  38.57 
 
 		 599 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  35.34 
 
 		 539 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  37.73 
 
 		 574 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  40.31 
 
 		 559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  35.51 
 
 		 682 aa  284  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  34.56 
 
 		 694 aa  284  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  39.16 
 
 		 586 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  34.44 
 
 		 586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  37.79 
 
 		 574 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  37.94 
 
 		 646 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  35 
 
 		 593 aa  282  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  37.79 
 
 		 574 aa  283  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>