More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1585 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 255 aa  527  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  43.31 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  30.93 
 
 		 663 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  29.55 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 637 aa  79.3  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  25.88 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  27.9 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 675 aa  75.5  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  23.64 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  23.31 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  27.67 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  20 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  28.87 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  27.14 
 
 		 541 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  23.63 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  24.41 
 
 		 262 aa  62  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1833  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.6 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  27.84 
 
 		 541 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2575  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  33.82 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  26.67 
 
 		 541 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  34.09 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  28.94 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2097  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1858  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  33.82 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1752  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  33.82 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000168259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 581 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  26.67 
 
 		 541 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.27 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  22.41 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  40 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  37.17 
 
 		 638 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0182  hypothetical protein  27.72 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.168407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  24.66 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  26.25 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1838  cyclopropane fatty acid synthase  31.78 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.85 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1058  methyltransferase type 12  27.47 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  35.71 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1786  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  33.82 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0118035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  39.02 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.64 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2027  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1523  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32.35 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1916  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32.35 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0810656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1560  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32.35 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1747  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32.35 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00423906  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1537  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32.35 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.225351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1720  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.08 
 
 		 440 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.9 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  34.41 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.45 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  26.6 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.08 
 
 		 482 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2766  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.29 
 
 		 450 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000280871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3450  methyltransferase type 12  27.74 
 
 		 356 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4014  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.4 
 
 		 435 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.922608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  26.11 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.46 
 
 		 450 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000412374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0329  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  33.33 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  26.11 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.44 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.13 
 
 		 429 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1647  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.08 
 
 		 436 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0262651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  28.49 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1527  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.34 
 
 		 394 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2374  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32.35 
 
 		 382 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.049386  normal  0.0849585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  28.85 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  23.89 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.46 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  33.03 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  25.1 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>