More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32360 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
530 aa  1027    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  81.92 
 
 
531 aa  786    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  52.53 
 
 
533 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.18 
 
 
538 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.37 
 
 
537 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  48.15 
 
 
533 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  62.57 
 
 
562 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  62.58 
 
 
518 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  60.48 
 
 
540 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  46.72 
 
 
540 aa  348  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
623 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  61.13 
 
 
538 aa  337  5e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  51.8 
 
 
540 aa  333  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  44.07 
 
 
545 aa  330  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.53 
 
 
542 aa  327  3e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  58.82 
 
 
543 aa  326  6e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.21 
 
 
394 aa  325  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  56.67 
 
 
407 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.28 
 
 
538 aa  319  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.18 
 
 
545 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.71 
 
 
538 aa  311  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  47.51 
 
 
542 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.65 
 
 
535 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.76 
 
 
528 aa  306  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.56 
 
 
544 aa  303  5.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.61 
 
 
546 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  45.05 
 
 
583 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.18 
 
 
522 aa  289  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 
545 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  50.61 
 
 
347 aa  280  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.75 
 
 
535 aa  279  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.83 
 
 
544 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.11 
 
 
547 aa  274  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.18 
 
 
904 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.58 
 
 
523 aa  260  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  52.22 
 
 
535 aa  259  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.75 
 
 
1150 aa  253  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.91 
 
 
538 aa  252  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  40.92 
 
 
540 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.33 
 
 
858 aa  249  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.85 
 
 
536 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 
532 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49 
 
 
702 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.19 
 
 
550 aa  230  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.28 
 
 
545 aa  227  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.92 
 
 
531 aa  224  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 
529 aa  223  9e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.5 
 
 
715 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.2 
 
 
562 aa  216  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.94 
 
 
526 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.34 
 
 
530 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 
539 aa  210  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.31 
 
 
524 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.19 
 
 
572 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  31.85 
 
 
563 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  53.81 
 
 
965 aa  204  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.36 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 
535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
686 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 
563 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.67 
 
 
560 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 
712 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 
554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 
566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 
711 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
712 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.57 
 
 
650 aa  194  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.11 
 
 
657 aa  194  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.3 
 
 
566 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 
561 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 
730 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  30.88 
 
 
561 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.47 
 
 
573 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.37 
 
 
449 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 
563 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.39 
 
 
625 aa  191  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 
515 aa  190  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 
730 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.41 
 
 
493 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 
656 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 
564 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 
563 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.83 
 
 
675 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  31.71 
 
 
561 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.46 
 
 
688 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.73 
 
 
731 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  30.78 
 
 
563 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 
573 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.55 
 
 
560 aa  187  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 
561 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 
673 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 
688 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  44.27 
 
 
533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.04 
 
 
561 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 
562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 
688 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
567 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 
674 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.22 
 
 
540 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>