217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31580 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  100 
 
 		 551 aa  1074    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  50 
 
 		 530 aa  475  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  50.66 
 
 		 499 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  50.98 
 
 		 580 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  45.65 
 
 		 584 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  54.52 
 
 		 535 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  45.09 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  43.69 
 
 		 580 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  60.18 
 
 		 628 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  53.82 
 
 		 605 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  39.89 
 
 		 556 aa  230  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  39.67 
 
 		 508 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  36.45 
 
 		 507 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  36.6 
 
 		 585 aa  204  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  36.83 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  45.94 
 
 		 603 aa  192  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  38.8 
 
 		 568 aa  187  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  35.6 
 
 		 620 aa  187  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  36.26 
 
 		 602 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  44.56 
 
 		 714 aa  140  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  33.24 
 
 		 516 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  52.07 
 
 		 222 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  33.06 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  32.8 
 
 		 567 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  28.17 
 
 		 426 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.82 
 
 		 443 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  29.75 
 
 		 443 aa  117  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.22 
 
 		 567 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  44.7 
 
 		 748 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  27.87 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  31.89 
 
 		 310 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  30.13 
 
 		 512 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  40.23 
 
 		 360 aa  98.6  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  31.4 
 
 		 637 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  42.76 
 
 		 485 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  29.18 
 
 		 408 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  28.39 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  25.72 
 
 		 457 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  25.89 
 
 		 426 aa  92  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  25.89 
 
 		 434 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  29.92 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  28.46 
 
 		 405 aa  90.9  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  27.2 
 
 		 405 aa  90.5  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  27 
 
 		 547 aa  90.1  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  26.83 
 
 		 404 aa  89.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  25.61 
 
 		 434 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  25.61 
 
 		 434 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  27.12 
 
 		 474 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  43.65 
 
 		 521 aa  88.6  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  40.91 
 
 		 469 aa  87  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  25.54 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  28.69 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  26.35 
 
 		 594 aa  84  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  26.88 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  26.78 
 
 		 475 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  28.41 
 
 		 502 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  26.54 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  28.01 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  27.21 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  27.21 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  27.11 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  35.25 
 
 		 561 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  27.65 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  33.57 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  40.48 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  31.99 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 743 aa  77.8  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  25.07 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  24.73 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  42.24 
 
 		 620 aa  77  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  26.96 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  25.07 
 
 		 377 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  25.82 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  31.27 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  25.07 
 
 		 377 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  25.82 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  31.27 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  37.59 
 
 		 572 aa  76.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  25.54 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  28.28 
 
 		 566 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  30.18 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  29.63 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  36.36 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  52.17 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  26.06 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3610  hypothetical protein  34.53 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  37.3 
 
 		 553 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  38.02 
 
 		 169 aa  73.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  40 
 
 		 709 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  27.76 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  31.89 
 
 		 578 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  31.35 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  29.96 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  31.35 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  51.35 
 
 		 578 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  34.53 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  54.41 
 
 		 593 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  54.41 
 
 		 593 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  37.3 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>