26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3610 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3610  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  447  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  92.89 
 
 
508 aa  337  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  68.66 
 
 
556 aa  255  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  55.45 
 
 
507 aa  202  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  43.46 
 
 
585 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  47.19 
 
 
620 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  47.02 
 
 
566 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  45.21 
 
 
568 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  38.57 
 
 
580 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  36.3 
 
 
584 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  33.09 
 
 
530 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  39.57 
 
 
580 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  39.26 
 
 
535 aa  69.3  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  34.39 
 
 
628 aa  69.3  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  38.57 
 
 
605 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  38.52 
 
 
558 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  32.37 
 
 
551 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  33.09 
 
 
603 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  34.48 
 
 
499 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  36.07 
 
 
714 aa  52.4  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  35.61 
 
 
516 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  29.08 
 
 
602 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  31.82 
 
 
567 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  37.18 
 
 
512 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  34.58 
 
 
405 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  33.94 
 
 
403 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>