More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10380 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10380  ribonuclease HII  100 
 
 		 258 aa  522  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000218298  unclonable  0.00000000118399 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  59.14 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1405  Ribonuclease H  61.78 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000142088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0699  Ribonuclease H  50 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000499736  hitchhiker  0.00000400312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  41.6 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  38.84 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  36.86 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  37.01 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  37.14 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  37.35 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  38.68 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  35.55 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  36.21 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  41.83 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  36.11 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  41.12 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 299 aa  145  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  35.97 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  35.57 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  42.25 
 
 		 206 aa  142  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  38.55 
 
 		 254 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  38.71 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  38.31 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  37.55 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  39.39 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  38.71 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  38.71 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  39.46 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  37.75 
 
 		 259 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  38.71 
 
 		 257 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  38.71 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  38.71 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  36 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  39.45 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  35.74 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  35.74 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  42.92 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  42.92 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  38.98 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  43.82 
 
 		 198 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  36.55 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  42.08 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  43.48 
 
 		 212 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  41.53 
 
 		 208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1971  Ribonuclease H  40.64 
 
 		 182 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0578493  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  36.31 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  42.7 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  34.68 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 238 aa  129  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 238 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  38.61 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  43.33 
 
 		 198 aa  128  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  42.47 
 
 		 209 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  42.47 
 
 		 209 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  37.95 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  44.32 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  42.39 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  42.54 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  37.43 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  43.43 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  36.73 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  40.32 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  41.01 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  42.54 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  42.31 
 
 		 198 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  40.64 
 
 		 221 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  41.27 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  43.06 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  41.67 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  39.53 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 198 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 198 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 183 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  40.62 
 
 		 212 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  42.54 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  40.88 
 
 		 240 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  40.62 
 
 		 212 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  40.88 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  40.78 
 
 		 214 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  39.53 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  40.45 
 
 		 203 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  34.57 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>