More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3369 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 843 aa  1717    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.26 
 
 		 709 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  31.66 
 
 		 889 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  31.89 
 
 		 905 aa  312  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.51 
 
 		 947 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  30.54 
 
 		 893 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  28.1 
 
 		 908 aa  304  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  27.91 
 
 		 908 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  28.35 
 
 		 908 aa  300  8e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  28.15 
 
 		 1003 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  31.63 
 
 		 890 aa  298  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  30.38 
 
 		 904 aa  293  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  29.41 
 
 		 936 aa  293  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  37.55 
 
 		 919 aa  289  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  29 
 
 		 953 aa  289  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  27.4 
 
 		 908 aa  289  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.41 
 
 		 984 aa  288  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  30.42 
 
 		 918 aa  287  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.26 
 
 		 927 aa  283  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  38.03 
 
 		 927 aa  282  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  30.47 
 
 		 916 aa  282  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  38.36 
 
 		 926 aa  281  4e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  38.58 
 
 		 924 aa  278  4e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  31.5 
 
 		 906 aa  277  7e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  38.33 
 
 		 924 aa  275  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  29.19 
 
 		 909 aa  274  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  34.9 
 
 		 1055 aa  273  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  37.58 
 
 		 924 aa  272  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.46 
 
 		 933 aa  266  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.87 
 
 		 952 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.37 
 
 		 919 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.11 
 
 		 951 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.85 
 
 		 996 aa  266  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.27 
 
 		 922 aa  265  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  35.82 
 
 		 935 aa  264  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.16 
 
 		 931 aa  263  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.28 
 
 		 951 aa  263  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  38.24 
 
 		 940 aa  259  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  28.89 
 
 		 906 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.1 
 
 		 950 aa  254  6e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.86 
 
 		 918 aa  251  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  32.78 
 
 		 877 aa  250  7e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.47 
 
 		 917 aa  250  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  27.8 
 
 		 972 aa  250  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.86 
 
 		 918 aa  250  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.86 
 
 		 918 aa  250  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.21 
 
 		 929 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  34.4 
 
 		 998 aa  246  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.28 
 
 		 762 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  33.8 
 
 		 967 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  33.6 
 
 		 967 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  26 
 
 		 1068 aa  243  7.999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  33.03 
 
 		 863 aa  239  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.79 
 
 		 921 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  35.58 
 
 		 872 aa  233  8.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.9 
 
 		 932 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  34.17 
 
 		 1073 aa  229  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  25.11 
 
 		 1068 aa  227  7e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.64 
 
 		 815 aa  227  8e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  33.69 
 
 		 933 aa  224  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  34.14 
 
 		 952 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.08 
 
 		 817 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.38 
 
 		 837 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.47 
 
 		 837 aa  184  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.3 
 
 		 894 aa  183  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.57 
 
 		 838 aa  179  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.93 
 
 		 847 aa  178  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.87 
 
 		 876 aa  178  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.32 
 
 		 866 aa  177  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.79 
 
 		 861 aa  177  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.15 
 
 		 710 aa  177  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.16 
 
 		 873 aa  176  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.79 
 
 		 861 aa  177  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  30.98 
 
 		 861 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.93 
 
 		 852 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.93 
 
 		 852 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.93 
 
 		 852 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.8 
 
 		 851 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.38 
 
 		 950 aa  174  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.69 
 
 		 848 aa  174  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  30.09 
 
 		 869 aa  174  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.44 
 
 		 868 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.89 
 
 		 835 aa  173  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  30.37 
 
 		 842 aa  172  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  33.24 
 
 		 853 aa  171  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.37 
 
 		 861 aa  171  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.71 
 
 		 869 aa  171  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.54 
 
 		 827 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  28.73 
 
 		 860 aa  168  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  29.86 
 
 		 855 aa  167  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  30.25 
 
 		 891 aa  167  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  29.86 
 
 		 842 aa  167  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.17 
 
 		 832 aa  167  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  32.04 
 
 		 885 aa  166  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.07 
 
 		 950 aa  165  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  31.9 
 
 		 830 aa  165  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  28.35 
 
 		 877 aa  165  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  30.02 
 
 		 885 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.09 
 
 		 847 aa  164  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.18 
 
 		 832 aa  163  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>