More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2375 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  100 
 
 		 408 aa  808    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  39.89 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  38.62 
 
 		 372 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  37.5 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  38.11 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  39.47 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  36.6 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.94 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  34.48 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  35.85 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  35.85 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  33.69 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  33.42 
 
 		 412 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  32.97 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  30.91 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  29.54 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  33.33 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  29.27 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  32.88 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  31.15 
 
 		 432 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  30.37 
 
 		 415 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  32.37 
 
 		 409 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  34.99 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  33.87 
 
 		 413 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.87 
 
 		 376 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  34.73 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  34.04 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  36.94 
 
 		 376 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.09 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  33.51 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  32.53 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  38.62 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  32.7 
 
 		 376 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  32.52 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  36.89 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  32.37 
 
 		 382 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  36.13 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  35.53 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  32.11 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  35.86 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  34.82 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  35.12 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  39.08 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  37.93 
 
 		 391 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  35.81 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  31.61 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.73 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  34.63 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  35.23 
 
 		 381 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  31.2 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  31.58 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  29.28 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.86 
 
 		 363 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.2 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.2 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  28.93 
 
 		 436 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  29.18 
 
 		 436 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  30.67 
 
 		 416 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  31.97 
 
 		 428 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  30.1 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  33.01 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  35.57 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  29.18 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  32.63 
 
 		 387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  30.42 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  30.65 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  28.31 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  27.59 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  28.69 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  27.18 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  30.08 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  26.84 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  28.37 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  31.48 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  30.2 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  28.93 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  27.49 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  29.68 
 
 		 402 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  28.47 
 
 		 436 aa  86.3  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  28.95 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  28.5 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  21.28 
 
 		 743 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  25.9 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.12 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.12 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  32.54 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  28.04 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  28.35 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  24.55 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  25.9 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3346  peptidase M20  28.57 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0581129 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  25.17 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  27.91 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  29.49 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  26.45 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  27.48 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  28.08 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  29.75 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.49 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  25.87 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>