More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0624 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0624  major facilitator transporter  100 
 
 
475 aa  920  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  33.69 
 
 
492 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.89 
 
 
474 aa  202  2e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.9 
 
 
498 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.69 
 
 
508 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.47 
 
 
487 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  31.22 
 
 
497 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  33.67 
 
 
454 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.83 
 
 
487 aa  182  9e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.88 
 
 
490 aa  181  3e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  32.52 
 
 
490 aa  180  6e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.39 
 
 
788 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.69 
 
 
514 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.82 
 
 
553 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 
519 aa  167  3e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  33.33 
 
 
482 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.62 
 
 
509 aa  166  6e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
486 aa  166  7e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2088  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
492 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 
491 aa  162  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.92 
 
 
478 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  6.83759e-05 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.92 
 
 
522 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.31 
 
 
1112 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.84 
 
 
469 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.04 
 
 
534 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 
518 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.57 
 
 
500 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  36.38 
 
 
492 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
480 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 
479 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1215  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 
477 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 
507 aa  154  3e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
506 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.24 
 
 
484 aa  153  6e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  30.18 
 
 
469 aa  153  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 
486 aa  152  9e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 
486 aa  152  9e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 
486 aa  152  9e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 
486 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 
486 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.69 
 
 
505 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 
486 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.19 
 
 
478 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.57 
 
 
527 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  29.8 
 
 
458 aa  152  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.48 
 
 
583 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.41 
 
 
467 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
501 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
494 aa  149  1e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 
478 aa  149  1e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 
463 aa  148  2e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.71 
 
 
501 aa  148  2e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 
478 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 
502 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
480 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
480 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
480 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.87 
 
 
522 aa  147  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  31.19 
 
 
463 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  2.85964e-05 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
480 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
480 aa  146  7e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  30.75 
 
 
470 aa  146  7e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  34.75 
 
 
480 aa  146  8e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
480 aa  146  8e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  31.33 
 
 
457 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 
733 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.85 
 
 
499 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.94 
 
 
487 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 
530 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.7 
 
 
476 aa  146  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  32.31 
 
 
468 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 
479 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
518 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 
478 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
487 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 
513 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  36.5 
 
 
505 aa  143  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  31.81 
 
 
470 aa  143  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  7.00007e-06 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  32.5 
 
 
471 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.56 
 
 
482 aa  142  1e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  29.46 
 
 
528 aa  142  1e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
506 aa  142  1e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
471 aa  142  1e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.67 
 
 
757 aa  141  2e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.5 
 
 
499 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 
520 aa  140  4e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 
482 aa  140  5e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 
482 aa  140  5e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
511 aa  140  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  31.22 
 
 
483 aa  140  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
504 aa  139  9e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 
496 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 
487 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 
539 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 
452 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  31.48 
 
 
489 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 
534 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371671  normal  0.0821497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.05 
 
 
521 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.78 
 
 
497 aa  137  3e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  28.79 
 
 
498 aa  137  3e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>