More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2160 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2160  peptide deformylase  100 
 
 		 171 aa  350  7e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  61.4 
 
 		 171 aa  209  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  61.88 
 
 		 172 aa  197  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  61.01 
 
 		 174 aa  195  3e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1690  peptide deformylase  56.41 
 
 		 172 aa  183  9e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.736434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  50.3 
 
 		 178 aa  175  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  51.9 
 
 		 175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0201  peptide deformylase  51.9 
 
 		 175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1477  peptide deformylase  52.83 
 
 		 173 aa  164  8e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  51.27 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  45.88 
 
 		 178 aa  157  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  43.64 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  47.77 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  44.24 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  41.82 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  41.82 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  42.51 
 
 		 178 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  44.71 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  47.68 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  43.2 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  43.53 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  41.82 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  41.82 
 
 		 170 aa  134  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  42.01 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  41.21 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  46.67 
 
 		 156 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  41.21 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  45.7 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  45.7 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  41.04 
 
 		 182 aa  130  6.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  41.21 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  40.61 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  42.69 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  40.61 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  43.55 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  41.21 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  41.36 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  45.03 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  45.03 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  45.03 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  42.51 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  38.92 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  42.07 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  45.03 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  41.86 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  44.51 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  40.74 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  45.03 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  41.57 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  43.87 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  43.87 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  41.86 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  40.96 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  42.35 
 
 		 174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  41.21 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  41.21 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  41.57 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  41.21 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  40.96 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  40.96 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  41.21 
 
 		 177 aa  127  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  40.96 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  40.96 
 
 		 181 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  40.24 
 
 		 170 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  44 
 
 		 180 aa  127  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  41.52 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  40.36 
 
 		 216 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  42.42 
 
 		 172 aa  127  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  40.36 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  44.67 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  40.7 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  40.36 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  42.44 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  41.28 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  40.61 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  40.61 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  40.61 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  40.36 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  41.07 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  41.07 
 
 		 196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  40.36 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  40.24 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  40.36 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  42.01 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  40.24 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  40.36 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  40.36 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  39.39 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  41.46 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  41.28 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  40.24 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  40.24 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  41.98 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  41.98 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  41.98 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.88 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>