237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3632 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  44.38 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  44.32 
 
 		 178 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  44.32 
 
 		 178 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  44.94 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  42.29 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  42.29 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  41.71 
 
 		 184 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  39.2 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  40.57 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  39.23 
 
 		 179 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  38.64 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  38.15 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  33.14 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  32.57 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  34.09 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  29.38 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  32.69 
 
 		 176 aa  97.4  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  32.69 
 
 		 176 aa  97.4  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  32.56 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  30.34 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  30.68 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  26.74 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  35.63 
 
 		 515 aa  61.2  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  26.24 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  28.99 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  27.34 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.63 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  29.84 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  32.32 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.93 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  25.87 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  29.63 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  26.24 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  25.55 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  24.63 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  33.72 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  24.63 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  24.82 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  26.76 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 444 aa  55.1  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  24.56 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  22.88 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  22.31 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  25.32 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  26.03 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  27.34 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  26.06 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  25.81 
 
 		 148 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  24.09 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  26.32 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  31.46 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  25.17 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  25.69 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  28.68 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  27.34 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  25.18 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  21.43 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  30.95 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  28.57 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  26.37 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  25.49 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  26.53 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  28.24 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  29.76 
 
 		 158 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  34.57 
 
 		 181 aa  51.2  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  30.95 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  23.75 
 
 		 344 aa  51.2  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  23.53 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  31.52 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  25.38 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  22.22 
 
 		 779 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  29.71 
 
 		 531 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  28.38 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  28.87 
 
 		 466 aa  50.4  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.87 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0776  CheW protein  26.85 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.01614 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.87 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  24.09 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  35.14 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  26.28 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  35.14 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  22.58 
 
 		 478 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.87 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  35.14 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  26.19 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  23.88 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  24.44 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  27.52 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3197  purine-binding chemotaxis protein CheW, putative  25.9 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  29.27 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0521  hypothetical protein  33.9 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  33.33 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  27.52 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  29.6 
 
 		 533 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4675  CheW protein  30.09 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  27.52 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  26.47 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  28.93 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  30.34 
 
 		 520 aa  48.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>