33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3197 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3197  purine-binding chemotaxis protein CheW, putative  100 
 
 		 138 aa  270  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0723  putative CheW protein  33.08 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0624  CheW protein  31.3 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2293  putative CheW protein  44.78 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0638  CheW protein  29.55 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07762e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0075  CheW protein  31.9 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  23.7 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  25.9 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  32.29 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  29.35 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  25.83 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  31.71 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  31.71 
 
 		 184 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  23.48 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  31.71 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  30.19 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  33.73 
 
 		 194 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  27 
 
 		 176 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0213  CheW protein  33.68 
 
 		 141 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  31.48 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  33.33 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  34.55 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  35.59 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  30.77 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0728  CheW protein  28.33 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000233542  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  36.21 
 
 		 171 aa  40.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  35.59 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  35.59 
 
 		 185 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  35.48 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  25.34 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  24.56 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  35.48 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.48 
 
 		 164 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>