186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0624 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0624  CheW protein  100 
 
 		 144 aa  284  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0638  CheW protein  92.09 
 
 		 146 aa  253  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07762e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0723  putative CheW protein  41.54 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0075  CheW protein  32.61 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3334  CheW protein  32.59 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3197  purine-binding chemotaxis protein CheW, putative  31.3 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  29.08 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  35.64 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  27.78 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  25.93 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  35.64 
 
 		 212 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  25 
 
 		 159 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  26.09 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  25 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  25 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  25 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  25 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  25 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  26.09 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  36.36 
 
 		 212 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  23.91 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  25 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  25 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  25 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  25 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  25 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  25 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  32.22 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  23.91 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  25 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  25 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  27.17 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.91 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  26.32 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  23.91 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  31.18 
 
 		 779 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  25 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  23.91 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  23.91 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  25.93 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  23.91 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  23.91 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  24.07 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  24.07 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  25 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  28.12 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  28.37 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  29.35 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.91 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.09 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  26.09 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  28.37 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.57 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  26.09 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  23.97 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  33.81 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  25.55 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  23.97 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.43 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  27.37 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  26.88 
 
 		 173 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  25 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2293  putative CheW protein  31.16 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  32.67 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  30.68 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.26 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  30.68 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  26.47 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  31.87 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  32.63 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  28.42 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.87 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  27.78 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  32.61 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  23.71 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  25.49 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  26.32 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.87 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  25.81 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  28.26 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.87 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  33.87 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  34.55 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  28.26 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  22.37 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  25 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  29.41 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  30.11 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  25.26 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  29.51 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  36.07 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  27.19 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  25 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  34.72 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  29.51 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  35.44 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  25.23 
 
 		 907 aa  42.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  28.71 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  25.26 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>