242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0073 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  100 
 
 		 545 aa  1142    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  75.82 
 
 		 539 aa  863    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  66.09 
 
 		 527 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  64.94 
 
 		 519 aa  679    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  77.66 
 
 		 535 aa  879    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  77.47 
 
 		 535 aa  886    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  60.07 
 
 		 532 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  77.64 
 
 		 539 aa  886    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  62.6 
 
 		 533 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  98.17 
 
 		 540 aa  1102    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  63.92 
 
 		 517 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  79.44 
 
 		 546 aa  897    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  96.91 
 
 		 549 aa  1111    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  97.61 
 
 		 538 aa  1101    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  61.12 
 
 		 521 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  59.22 
 
 		 507 aa  599  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  37.69 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  33.72 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  32.74 
 
 		 508 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  30.57 
 
 		 511 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  30.57 
 
 		 513 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  32.63 
 
 		 502 aa  209  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  28.51 
 
 		 688 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  28.14 
 
 		 693 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  31.69 
 
 		 670 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  29.8 
 
 		 669 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 645 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  33.46 
 
 		 656 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  26.07 
 
 		 485 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  26.59 
 
 		 475 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  25.85 
 
 		 495 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  25.33 
 
 		 668 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 		 675 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 476 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  29.88 
 
 		 740 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  22.82 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  24.78 
 
 		 515 aa  104  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  25.71 
 
 		 525 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  23.19 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  26.02 
 
 		 495 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  23.52 
 
 		 522 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  25.58 
 
 		 533 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  25.58 
 
 		 508 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  25.58 
 
 		 508 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  26.55 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  33.65 
 
 		 545 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  27.84 
 
 		 546 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  26 
 
 		 500 aa  94.7  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  24.69 
 
 		 612 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  23.75 
 
 		 518 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  22.88 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  24.63 
 
 		 520 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  29.8 
 
 		 505 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  20.53 
 
 		 480 aa  90.1  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  29.35 
 
 		 499 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  27.64 
 
 		 504 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  27.73 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  24.35 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  23.09 
 
 		 564 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 505 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  25.42 
 
 		 511 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  25.42 
 
 		 511 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  25.42 
 
 		 511 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  28.7 
 
 		 680 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  25 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  24.11 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  24.32 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  23.57 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  24.95 
 
 		 516 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  24.76 
 
 		 507 aa  83.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  29.17 
 
 		 527 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.01 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  30.12 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  26.58 
 
 		 504 aa  81.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  23.54 
 
 		 571 aa  81.6  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  23.86 
 
 		 535 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  22.2 
 
 		 506 aa  80.1  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  25.86 
 
 		 521 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  26.48 
 
 		 750 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  25.58 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  26.29 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  26.69 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  23.55 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  27 
 
 		 556 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  22.47 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  32.14 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  23.47 
 
 		 524 aa  76.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  29.03 
 
 		 540 aa  76.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  22 
 
 		 544 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  24.9 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  31.18 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  22.81 
 
 		 532 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  25.76 
 
 		 643 aa  74.7  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  22.79 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  29.61 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  23.52 
 
 		 542 aa  74.3  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  22.49 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  21.28 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  26.82 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>