243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0076 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  76.7 
 
 
535 aa  872  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  62.7 
 
 
533 aa  660  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  65.76 
 
 
519 aa  677  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  95.45 
 
 
538 aa  1082  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  76.33 
 
 
539 aa  879  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  4.58817e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  100 
 
 
549 aa  1150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  75.81 
 
 
539 aa  868  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  66.74 
 
 
527 aa  662  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  62.89 
 
 
532 aa  654  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  76.52 
 
 
535 aa  881  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  96.91 
 
 
545 aa  1111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  79.81 
 
 
546 aa  898  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  96.17 
 
 
540 aa  1091  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  64.17 
 
 
517 aa  642  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  61.62 
 
 
521 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  58.57 
 
 
507 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  37.25 
 
 
480 aa  337  2e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  33.49 
 
 
533 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  32.74 
 
 
508 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  30.79 
 
 
511 aa  216  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  30.79 
 
 
513 aa  216  1e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  32.17 
 
 
502 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 
693 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  28.51 
 
 
688 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.78424e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  31.46 
 
 
670 aa  180  6e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  29.42 
 
 
669 aa  175  2e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
645 aa  130  7e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  33.46 
 
 
656 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  26.07 
 
 
485 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  26.11 
 
 
475 aa  123  1e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  25.74 
 
 
495 aa  114  4e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 
680 aa  114  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
503 aa  114  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  25.05 
 
 
668 aa  112  1e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 
675 aa  112  1e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  25.99 
 
 
476 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  29.46 
 
 
740 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  25.71 
 
 
525 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  23.43 
 
 
477 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  25.74 
 
 
495 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  22.82 
 
 
484 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  25.22 
 
 
515 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  25.74 
 
 
508 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  25.74 
 
 
508 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  25.74 
 
 
533 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  23.08 
 
 
522 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  28.57 
 
 
546 aa  95.9  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  33.65 
 
 
545 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  29.03 
 
 
494 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  26.25 
 
 
500 aa  95.1  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  25.05 
 
 
520 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  20.77 
 
 
480 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  24.69 
 
 
612 aa  90.5  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
505 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  29.44 
 
 
505 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  27.13 
 
 
499 aa  90.1  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  26.09 
 
 
511 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  26.09 
 
 
511 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  23.04 
 
 
489 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  26.09 
 
 
511 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  27.73 
 
 
505 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  27.9 
 
 
504 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  22.85 
 
 
518 aa  88.2  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  24.7 
 
 
508 aa  87.8  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  24.14 
 
 
524 aa  87.8  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  25.62 
 
 
485 aa  86.7  1e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  24.57 
 
 
521 aa  85.1  3e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  24.76 
 
 
507 aa  84.7  4e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  24.84 
 
 
516 aa  84.3  5e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  29.17 
 
 
527 aa  83.2  1e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  24.09 
 
 
535 aa  82  2e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  23.34 
 
 
564 aa  82.4  2e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  23.88 
 
 
506 aa  82  3e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.09 
 
 
505 aa  82  3e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  2.58971e-05  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  23.15 
 
 
506 aa  81.3  4e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  24.54 
 
 
515 aa  80.5  8e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.73 
 
 
478 aa  80.1  1e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  26.24 
 
 
521 aa  79.7  1e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  26.43 
 
 
520 aa  78.2  3e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  26.69 
 
 
300 aa  78.2  3e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  23.62 
 
 
547 aa  78.6  3e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  23.57 
 
 
571 aa  77.8  5e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  27 
 
 
556 aa  77.4  6e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  32.14 
 
 
527 aa  77  8e-13  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  25.88 
 
 
504 aa  76.6  1e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  23.73 
 
 
499 aa  76.6  1e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  23.23 
 
 
523 aa  76.3  1e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  29.58 
 
 
540 aa  75.9  2e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  24.04 
 
 
542 aa  75.9  2e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  31.18 
 
 
459 aa  75.5  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  25.06 
 
 
525 aa  75.5  3e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  22 
 
 
544 aa  75.1  3e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  22.89 
 
 
515 aa  75.1  3e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  22.81 
 
 
532 aa  74.7  4e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  26.05 
 
 
557 aa  74.3  5e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  23.35 
 
 
524 aa  74.3  5e-12  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  29.61 
 
 
532 aa  73.9  6e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
486 aa  73.9  8e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  25.69 
 
 
750 aa  73.6  9e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  22.42 
 
 
521 aa  73.2  1e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>