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for query gene Sbal195_0064 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0059  major facilitator transporter  99.38 
 
 
487 aa  951  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0060  major facilitator transporter  87.76 
 
 
482 aa  763  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0062  major facilitator transporter  87.97 
 
 
482 aa  763  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  6.90762e-08 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0064  major facilitator transporter  88.17 
 
 
482 aa  766  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.92111e-09 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0064  major facilitator transporter  100 
 
 
487 aa  955  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31678  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0063  major facilitator superfamily MFS_1  99.38 
 
 
487 aa  951  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4295  major facilitator transporter  98.97 
 
 
487 aa  946  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  51.47 
 
 
477 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2618  major facilitator transporter  53.75 
 
 
484 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.876226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.07 
 
 
501 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.98 
 
 
528 aa  233  4e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  34.43 
 
 
501 aa  233  8e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  7.43098e-05 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.19 
 
 
569 aa  232  9e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  33.57 
 
 
515 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 
504 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  33.19 
 
 
494 aa  227  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34 
 
 
526 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
483 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.65 
 
 
483 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.34 
 
 
483 aa  223  5e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.11 
 
 
483 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.12 
 
 
676 aa  220  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 
535 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 
565 aa  219  8e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 
530 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  33.26 
 
 
1062 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.54 
 
 
680 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.33 
 
 
504 aa  217  3e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 
505 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 
682 aa  215  1e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 
682 aa  215  1e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 
682 aa  215  1e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.05 
 
 
558 aa  214  2e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.98 
 
 
530 aa  213  5e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 
593 aa  213  6e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.7 
 
 
554 aa  213  6e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.18 
 
 
509 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  33.76 
 
 
537 aa  213  8e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  4.10629e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.04 
 
 
504 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 
504 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 
504 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 
539 aa  210  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 
525 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.78 
 
 
666 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 
621 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.01 
 
 
535 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 
522 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.02 
 
 
528 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 
516 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.12 
 
 
509 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.12 
 
 
509 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  33.47 
 
 
513 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.56 
 
 
509 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 
448 aa  206  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0773  major facilitator transporter  33.87 
 
 
518 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.68 
 
 
504 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 
650 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 
850 aa  204  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 
697 aa  203  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.55 
 
 
504 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.77 
 
 
505 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  2.99723e-07 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 
498 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 
514 aa  202  1e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 
592 aa  201  2e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
491 aa  201  2e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.75 
 
 
523 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 
685 aa  200  4e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
504 aa  200  4e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
504 aa  201  4e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
504 aa  201  4e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
504 aa  200  4e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.54 
 
 
526 aa  200  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.06 
 
 
526 aa  200  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.06 
 
 
526 aa  200  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
538 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  31.36 
 
 
666 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.05 
 
 
678 aa  199  8e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
519 aa  199  8e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.1 
 
 
504 aa  199  1e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.96 
 
 
685 aa  199  1e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 
685 aa  198  2e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.1 
 
 
504 aa  198  2e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.05 
 
 
520 aa  197  4e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  1.16602e-09 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.62 
 
 
513 aa  197  4e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.75 
 
 
524 aa  197  5e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 
512 aa  197  5e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  29.58 
 
 
507 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.45 
 
 
522 aa  196  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 
485 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
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NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 
562 aa  196  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
512 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.6 
 
 
575 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 
534 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.26 
 
 
478 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.35395e-06  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.26 
 
 
478 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 
561 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  29.26 
 
 
478 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.26976e-12  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 
525 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 
575 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  29.47 
 
 
478 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
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