More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4954 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
462 aa  919    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.39 
 
 
483 aa  306  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  43.32 
 
 
491 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  43.86 
 
 
378 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  38.39 
 
 
441 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  27.32 
 
 
456 aa  124  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  27.06 
 
 
456 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  30.84 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3126  FAD linked oxidase domain protein  43.31 
 
 
147 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  35.23 
 
 
461 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  38.89 
 
 
462 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  38.33 
 
 
462 aa  96.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  37.29 
 
 
499 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.87 
 
 
461 aa  94  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  34.04 
 
 
479 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  33.51 
 
 
479 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 
481 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  34.57 
 
 
479 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  36.31 
 
 
461 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  34.59 
 
 
468 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  29.95 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  40.99 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.39 
 
 
463 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.88 
 
 
473 aa  84  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.76 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  33.74 
 
 
477 aa  83.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.15 
 
 
989 aa  83.2  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.41 
 
 
465 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.92 
 
 
464 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.95 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  32.37 
 
 
1000 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  35.58 
 
 
460 aa  80.9  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.8 
 
 
456 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.8 
 
 
456 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  32.39 
 
 
474 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
758 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  35.8 
 
 
456 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.7 
 
 
472 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  29.56 
 
 
474 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  37.58 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.06 
 
 
474 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.12 
 
 
726 aa  77  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  37.29 
 
 
461 aa  77  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  31.25 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  33.5 
 
 
602 aa  76.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.66 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  32.37 
 
 
478 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  28.29 
 
 
473 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  34.72 
 
 
456 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  31.16 
 
 
1024 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  32.11 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.32 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  33.69 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  35.88 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.54 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  33.33 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  35.71 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.39 
 
 
473 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.81 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.65 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  32.29 
 
 
497 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.11 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  30.41 
 
 
1015 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  33.52 
 
 
470 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  30.68 
 
 
473 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  34.08 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.65 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  37.14 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  32.43 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  38.83 
 
 
466 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  36.02 
 
 
764 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.5 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  27.96 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  34.36 
 
 
465 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.73 
 
 
501 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.5 
 
 
510 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  26.77 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2790  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.25 
 
 
506 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.75 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  34.71 
 
 
452 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  28.31 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.49 
 
 
461 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  32.75 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  33.54 
 
 
752 aa  71.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  28.43 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  29.55 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  27.96 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.53 
 
 
705 aa  70.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  28.89 
 
 
560 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.11 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  33.89 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  31.95 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  33.89 
 
 
470 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  31.58 
 
 
1015 aa  70.5  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  32.62 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  32.39 
 
 
499 aa  70.5  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  32.87 
 
 
464 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.39 
 
 
472 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>