29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3126 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3126  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
147 aa  290  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.26 
 
 
483 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  48.18 
 
 
378 aa  110  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.31 
 
 
462 aa  102  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  40.37 
 
 
491 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  41.14 
 
 
441 aa  99.4  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  28.95 
 
 
447 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  29.68 
 
 
456 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  29.68 
 
 
456 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  33.09 
 
 
481 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.83 
 
 
475 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  27.39 
 
 
479 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  30.56 
 
 
477 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 
462 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  26.11 
 
 
479 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.06 
 
 
453 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.9 
 
 
464 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  28.78 
 
 
479 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  28.26 
 
 
462 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.95 
 
 
479 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  34.92 
 
 
465 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  44.23 
 
 
451 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_55040  d-lactate dehydrogenase  25 
 
 
506 aa  41.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  35.62 
 
 
461 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  29.37 
 
 
499 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.08 
 
 
481 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  25.64 
 
 
474 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  25.48 
 
 
473 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  31.65 
 
 
976 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>