More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1905 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  81.92 
 
 		 1031 aa  1737    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  46.16 
 
 		 1046 aa  888    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  38.41 
 
 		 1050 aa  661    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  35.83 
 
 		 1019 aa  654    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  38.63 
 
 		 1051 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  46.9 
 
 		 1042 aa  891    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2065  acriflavin resistance protein  37.17 
 
 		 1027 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.824615  normal  0.45428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.74 
 
 		 1024 aa  892    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  40.6 
 
 		 1040 aa  691    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  36.02 
 
 		 1019 aa  655    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0899  acriflavin resistance protein  38.82 
 
 		 1048 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0891  RND efflux transporter  37.5 
 
 		 1029 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668261  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  56.41 
 
 		 1029 aa  1150    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  38.73 
 
 		 1043 aa  680    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  37.49 
 
 		 1029 aa  644    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  82.12 
 
 		 1031 aa  1745    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.26 
 
 		 1046 aa  888    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  38.73 
 
 		 1043 aa  678    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00480  multidrug efflux pump  36.55 
 
 		 1040 aa  636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  46.74 
 
 		 1035 aa  902    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  36.54 
 
 		 1015 aa  646    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  36.64 
 
 		 1015 aa  647    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  46.52 
 
 		 1037 aa  910    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  44.43 
 
 		 1024 aa  812    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  81.96 
 
 		 1031 aa  1759    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2283  acriflavin resistance protein  37.61 
 
 		 1031 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.03 
 
 		 1057 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  45.05 
 
 		 1023 aa  834    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0201  acriflavin resistance protein  38.56 
 
 		 1028 aa  636    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  36.49 
 
 		 1040 aa  655    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  37.37 
 
 		 1026 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  37.01 
 
 		 1009 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  38.72 
 
 		 1048 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  83.19 
 
 		 1031 aa  1758    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  42.58 
 
 		 1025 aa  754    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  46.06 
 
 		 1047 aa  892    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  37.24 
 
 		 1029 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  82.3 
 
 		 1034 aa  1761    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  38.51 
 
 		 1051 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  53.54 
 
 		 1028 aa  1100    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  47.83 
 
 		 1045 aa  902    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  36.76 
 
 		 1017 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  44.71 
 
 		 1037 aa  860    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  38.22 
 
 		 1029 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  46.51 
 
 		 1035 aa  907    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  39.77 
 
 		 1064 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  62.29 
 
 		 1046 aa  1329    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3649  acriflavin resistance protein  37.44 
 
 		 1035 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  46.51 
 
 		 1036 aa  900    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1651  acriflavin resistance protein  37.49 
 
 		 1026 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  47.53 
 
 		 1038 aa  888    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  51.4 
 
 		 1048 aa  1027    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  83.09 
 
 		 1031 aa  1755    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  40.42 
 
 		 1051 aa  762    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  83.19 
 
 		 1031 aa  1756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  81.63 
 
 		 1031 aa  1683    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  41.98 
 
 		 1048 aa  740    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  37.75 
 
 		 1034 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  51.98 
 
 		 1041 aa  1016    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  58.74 
 
 		 1035 aa  1221    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2699  acriflavin resistance protein  37.81 
 
 		 1029 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  36.29 
 
 		 1032 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  45.97 
 
 		 1047 aa  889    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  57.49 
 
 		 1036 aa  1176    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8251  acriflavin resistance protein  37.36 
 
 		 1021 aa  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  39.37 
 
 		 1040 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  38.59 
 
 		 1026 aa  709    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  36.48 
 
 		 1030 aa  684    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  82.3 
 
 		 1042 aa  1761    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.95 
 
 		 1068 aa  796    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  46.36 
 
 		 1051 aa  887    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  83.19 
 
 		 1031 aa  1771    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  37.17 
 
 		 1032 aa  676    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  46.45 
 
 		 1051 aa  890    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  83.19 
 
 		 1031 aa  1771    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  36.64 
 
 		 1036 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  48.64 
 
 		 1036 aa  949    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  46.29 
 
 		 1034 aa  924    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  38.46 
 
 		 1044 aa  682    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  50.34 
 
 		 1040 aa  994    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  45.91 
 
 		 1036 aa  901    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09520  RND efflux transporter  38.05 
 
 		 1029 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  45.97 
 
 		 1047 aa  889    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  37.39 
 
 		 1018 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  44.06 
 
 		 1022 aa  856    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  59.69 
 
 		 1038 aa  1213    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  39.65 
 
 		 1037 aa  724    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  51.98 
 
 		 1041 aa  996    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  46.36 
 
 		 1051 aa  887    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  83.09 
 
 		 1031 aa  1770    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  39.09 
 
 		 1044 aa  696    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  46.06 
 
 		 1047 aa  889    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  81.23 
 
 		 1030 aa  1750    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  37.04 
 
 		 1018 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1034 aa  2087    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  57.84 
 
 		 1035 aa  1198    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  37.78 
 
 		 1049 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  44.59 
 
 		 1033 aa  869    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  83.28 
 
 		 1031 aa  1758    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  37.62 
 
 		 1034 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>