More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1731 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 291 aa  590  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  65.19 
 
 		 296 aa  388  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  65.17 
 
 		 292 aa  352  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  54.14 
 
 		 300 aa  332  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  54.83 
 
 		 296 aa  332  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  55.71 
 
 		 300 aa  332  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 		 291 aa  331  8e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  54.83 
 
 		 299 aa  331  9e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  54.48 
 
 		 296 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  54.14 
 
 		 296 aa  328  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  56.31 
 
 		 295 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  56.31 
 
 		 290 aa  321  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  53.26 
 
 		 291 aa  316  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  54.27 
 
 		 290 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  55.29 
 
 		 291 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  54.27 
 
 		 293 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 		 293 aa  311  6.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  52.41 
 
 		 298 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  54.76 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  54.76 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  50.51 
 
 		 293 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  54.08 
 
 		 294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 293 aa  302  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  52.38 
 
 		 294 aa  302  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 299 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  52.22 
 
 		 293 aa  298  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  52.41 
 
 		 326 aa  298  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  50.51 
 
 		 293 aa  296  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 		 294 aa  295  4e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  52.9 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 319 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 296 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  50.51 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 296 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 301 aa  271  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 301 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 300 aa  268  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 296 aa  265  8e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 294 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 294 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  45.08 
 
 		 307 aa  262  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 		 296 aa  261  8.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 320 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 323 aa  255  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 293 aa  255  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 290 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 290 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 302 aa  252  6e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 292 aa  248  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 292 aa  248  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 292 aa  247  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>