More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0243 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 159 aa  328  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  79.87 
 
 		 159 aa  271  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3286  50S ribosomal protein L13  75.47 
 
 		 159 aa  249  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  74.83 
 
 		 153 aa  244  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  72.3 
 
 		 187 aa  238  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  75.17 
 
 		 154 aa  236  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  71.81 
 
 		 154 aa  235  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  72.3 
 
 		 154 aa  231  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  73.65 
 
 		 154 aa  231  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  71.71 
 
 		 154 aa  231  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  71.71 
 
 		 154 aa  231  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  70.95 
 
 		 154 aa  229  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  71.62 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  71.14 
 
 		 154 aa  226  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  71.62 
 
 		 153 aa  225  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  70.95 
 
 		 153 aa  224  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  67.76 
 
 		 154 aa  223  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  68.92 
 
 		 154 aa  222  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  69.8 
 
 		 154 aa  223  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  69.59 
 
 		 156 aa  222  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4592  50S ribosomal protein L13  66.45 
 
 		 154 aa  221  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1378  ribosomal protein L13  69.59 
 
 		 156 aa  221  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  68.24 
 
 		 154 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1514  50S ribosomal protein L13  67.11 
 
 		 154 aa  221  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.8697  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  68.24 
 
 		 153 aa  220  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2649  50S ribosomal protein L13  69.59 
 
 		 153 aa  220  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2619  50S ribosomal protein L13  68.92 
 
 		 153 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2842  50S ribosomal protein L13  68.92 
 
 		 153 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  66.22 
 
 		 154 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2250  50S ribosomal protein L13  68 
 
 		 158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0067  50S ribosomal protein L13  62.42 
 
 		 152 aa  215  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  65.13 
 
 		 154 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  64.47 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  64.47 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4344  50S ribosomal protein L13  64.86 
 
 		 153 aa  210  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2426  50S ribosomal protein L13  67.57 
 
 		 164 aa  207  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0464276  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  64.86 
 
 		 154 aa  207  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 152 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3026  50S ribosomal protein L13  62.09 
 
 		 157 aa  204  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1477  50S ribosomal protein L13  61.04 
 
 		 160 aa  204  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.207503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 152 aa  203  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0840  50S ribosomal protein L13  54.67 
 
 		 152 aa  192  1e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.637892  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0822  50S ribosomal protein L13  54.73 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.865147  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1019  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2152  50S ribosomal protein L13  55.92 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0607483  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  54.3 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  52.7 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  54.79 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  52.32 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  52.32 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  52.7 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  53.96 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0052  50S ribosomal protein L13  51.01 
 
 		 149 aa  167  7e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  167  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  51.39 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  49.32 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  163  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  163  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  163  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  163  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  163  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  163  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 145 aa  163  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>