More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0500 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 524 aa  1055    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.93 
 
 		 515 aa  341  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.83 
 
 		 525 aa  333  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  39.5 
 
 		 517 aa  329  9e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  38.34 
 
 		 514 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.46 
 
 		 533 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.07 
 
 		 521 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.16 
 
 		 530 aa  309  8e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.42 
 
 		 510 aa  309  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.04 
 
 		 524 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.57 
 
 		 524 aa  300  5e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  37.09 
 
 		 530 aa  300  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.14 
 
 		 524 aa  299  9e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.69 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.4 
 
 		 514 aa  296  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  36.47 
 
 		 519 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.45 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  35.6 
 
 		 524 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  36.57 
 
 		 522 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.72 
 
 		 521 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.85 
 
 		 517 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.76 
 
 		 519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.08 
 
 		 513 aa  279  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.7 
 
 		 533 aa  274  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.73 
 
 		 500 aa  272  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.95 
 
 		 509 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.84 
 
 		 521 aa  266  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.35 
 
 		 498 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  34.45 
 
 		 511 aa  263  6.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.05 
 
 		 502 aa  259  8e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.42 
 
 		 501 aa  258  1e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.01 
 
 		 516 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 		 519 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  34.69 
 
 		 499 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.97 
 
 		 504 aa  249  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.66 
 
 		 515 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  30.96 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.84 
 
 		 492 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  36.24 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 493 aa  246  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.02 
 
 		 528 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 		 502 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.63 
 
 		 511 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 479 aa  240  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.86 
 
 		 533 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.91 
 
 		 506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.95 
 
 		 514 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.327318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  33.27 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.01 
 
 		 487 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0069  hypothetical protein  33.27 
 
 		 504 aa  231  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  32.25 
 
 		 499 aa  230  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.49 
 
 		 546 aa  229  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  32.42 
 
 		 496 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  31.66 
 
 		 499 aa  226  8e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  31.15 
 
 		 512 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  33.52 
 
 		 507 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.88 
 
 		 567 aa  223  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.42 
 
 		 556 aa  223  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.53 
 
 		 542 aa  222  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.12 
 
 		 530 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  31.99 
 
 		 499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  31.73 
 
 		 515 aa  220  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.31 
 
 		 507 aa  219  7.999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  31.12 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.16 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  30.77 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.59 
 
 		 518 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.54 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.25 
 
 		 512 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  31.13 
 
 		 513 aa  216  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 		 501 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  30.38 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.87 
 
 		 513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  34.77 
 
 		 500 aa  213  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.25 
 
 		 514 aa  213  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  31.33 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.15 
 
 		 490 aa  211  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.96 
 
 		 499 aa  211  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.5 
 
 		 516 aa  210  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  32.37 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.23 
 
 		 524 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.26 
 
 		 494 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.42 
 
 		 523 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  31.3 
 
 		 508 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.15 
 
 		 508 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.89 
 
 		 511 aa  206  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.47 
 
 		 494 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.96 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.13 
 
 		 499 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.2 
 
 		 494 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.51 
 
 		 500 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.76 
 
 		 496 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  30.23 
 
 		 515 aa  205  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.15 
 
 		 499 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  31.96 
 
 		 493 aa  203  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  30.96 
 
 		 504 aa  203  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  30.96 
 
 		 504 aa  203  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.47 
 
 		 518 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.13 
 
 		 514 aa  202  9e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.04 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>