More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2375 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.69 
 
 		 989 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  44.76 
 
 		 973 aa  736    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.32 
 
 		 962 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  42.92 
 
 		 984 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.83 
 
 		 961 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  41.32 
 
 		 1007 aa  648    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.02 
 
 		 1007 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 		 952 aa  1870    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.49 
 
 		 978 aa  762    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  37.13 
 
 		 975 aa  636    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.69 
 
 		 976 aa  752    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.42 
 
 		 977 aa  643    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  43.12 
 
 		 973 aa  676    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.3 
 
 		 991 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.38 
 
 		 1005 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.9 
 
 		 971 aa  632  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  35.66 
 
 		 967 aa  627  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.06 
 
 		 1015 aa  624  1e-177  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.06 
 
 		 1025 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.29 
 
 		 1032 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.56 
 
 		 1038 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.91 
 
 		 1046 aa  618  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  40.08 
 
 		 1032 aa  618  1e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.21 
 
 		 976 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.73 
 
 		 1025 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.82 
 
 		 1011 aa  611  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  39.63 
 
 		 996 aa  607  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  40.25 
 
 		 1014 aa  602  1.0000000000000001e-171  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.24 
 
 		 1009 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.83 
 
 		 1034 aa  605  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.78 
 
 		 983 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.48 
 
 		 968 aa  601  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  38.98 
 
 		 1055 aa  595  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.7 
 
 		 990 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.29 
 
 		 995 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  37.66 
 
 		 1070 aa  590  1e-167  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.76 
 
 		 990 aa  591  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  38.62 
 
 		 1024 aa  589  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.96 
 
 		 1035 aa  590  1e-167  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.68 
 
 		 990 aa  588  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  37.84 
 
 		 1023 aa  579  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  37.98 
 
 		 1024 aa  581  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  38.96 
 
 		 1015 aa  582  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.85 
 
 		 1023 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.26 
 
 		 983 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  40.96 
 
 		 1050 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  37.82 
 
 		 1013 aa  571  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  40.44 
 
 		 1050 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  40.15 
 
 		 1052 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  41.82 
 
 		 974 aa  561  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  36.08 
 
 		 984 aa  557  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  39.13 
 
 		 967 aa  555  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  39.86 
 
 		 987 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  35.76 
 
 		 930 aa  551  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.06 
 
 		 1031 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 		 1037 aa  535  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.88 
 
 		 999 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.39 
 
 		 1022 aa  534  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.3 
 
 		 989 aa  534  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  36 
 
 		 999 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.67 
 
 		 948 aa  531  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  36.49 
 
 		 1043 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.26 
 
 		 973 aa  518  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.32 
 
 		 945 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.75 
 
 		 950 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  38.34 
 
 		 976 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  34.45 
 
 		 976 aa  498  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  38.74 
 
 		 894 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.53 
 
 		 1006 aa  488  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.37 
 
 		 1000 aa  486  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  36.4 
 
 		 975 aa  478  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.18 
 
 		 966 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  36.33 
 
 		 997 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  36.69 
 
 		 949 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  37.16 
 
 		 985 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.7 
 
 		 997 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.86 
 
 		 974 aa  468  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.14 
 
 		 944 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.81 
 
 		 1050 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.25 
 
 		 906 aa  462  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  34.79 
 
 		 1010 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.47 
 
 		 947 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.99 
 
 		 995 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 		 1002 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.79 
 
 		 1028 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 		 1006 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  29.22 
 
 		 1013 aa  415  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1747  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.6 
 
 		 1018 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2071  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.4 
 
 		 1007 aa  406  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.999206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.8 
 
 		 1027 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003726  Fe-S oxidoreductase  29.42 
 
 		 1011 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000740961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  29.57 
 
 		 1018 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1872  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.68 
 
 		 1019 aa  399  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000561674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  33.79 
 
 		 993 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.44 
 
 		 977 aa  399  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  29.57 
 
 		 1018 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.47 
 
 		 1018 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.41 
 
 		 1013 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  29.57 
 
 		 1018 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2714  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.43 
 
 		 1023 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488036  normal  0.0122015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>