More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0241 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 332 aa  654    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3196  hypothetical protein  45.09 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0435858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  35.81 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  33.23 
 
 		 336 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  33.22 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  30.77 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  30.03 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  27.81 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  30.2 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  26.63 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  29.77 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2229  hypothetical protein  30.36 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  28.76 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  30.07 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4224  hypothetical protein  29.33 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  31.37 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2501  hypothetical protein  32.38 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  31.09 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  32.62 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  31.1 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  29.24 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  30.6 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  30.9 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3098  hypothetical protein  26.85 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  31.66 
 
 		 326 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  26.04 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  29.68 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  26.04 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  29.72 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  29.29 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  27.34 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  29.63 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3081  hypothetical protein  28.72 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  31.29 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  29.29 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  28.23 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  29.55 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  29.07 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  29.55 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  29.47 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  29.22 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  31.38 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  27.15 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  30.5 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36130  hypothetical protein  27.81 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  30.39 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  31.16 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  28.21 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  29.22 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  30.56 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2286  hypothetical protein  31.69 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  29.47 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  30.24 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  26.44 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  26.91 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  28.35 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  26.98 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  28.72 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  27.39 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  27.14 
 
 		 325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  28.32 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  29.37 
 
 		 328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  29.37 
 
 		 328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  28.92 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  27.3 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  27.14 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  26.3 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  29.68 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  30.77 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  26.35 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  26.3 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  27.97 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  27.14 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  29.72 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  29.02 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  29.01 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  29.22 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  28.32 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  29.9 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  27.34 
 
 		 322 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  28.47 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  27.97 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  27.41 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3823  hypothetical protein  27.27 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  30.87 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0277  hypothetical protein  29.62 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  28.48 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  28.88 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  27.49 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  28.67 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  30.56 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  30.64 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  31.68 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  26.69 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  29.27 
 
 		 329 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  27.34 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  30 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  24.03 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>