203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1952 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 704 aa  1404    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  68.73 
 
 		 702 aa  932    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  70.38 
 
 		 697 aa  956    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  42.1 
 
 		 653 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.72 
 
 		 680 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.15 
 
 		 688 aa  300  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  33.85 
 
 		 691 aa  297  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.28 
 
 		 672 aa  291  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.13 
 
 		 692 aa  291  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  30.93 
 
 		 698 aa  280  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  31.75 
 
 		 697 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  35.54 
 
 		 681 aa  273  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.45 
 
 		 670 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.39 
 
 		 680 aa  270  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  31.02 
 
 		 659 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.83 
 
 		 679 aa  267  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  37.29 
 
 		 679 aa  264  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  32.92 
 
 		 718 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  31.06 
 
 		 716 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  34.01 
 
 		 690 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  30.43 
 
 		 625 aa  253  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.1 
 
 		 700 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  31.39 
 
 		 713 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  31.55 
 
 		 719 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  31.91 
 
 		 707 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  31.6 
 
 		 707 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  31.6 
 
 		 707 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  30.84 
 
 		 710 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  31.08 
 
 		 700 aa  242  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  30.63 
 
 		 710 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  30.59 
 
 		 682 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  30.72 
 
 		 749 aa  230  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  32.79 
 
 		 687 aa  228  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  28.98 
 
 		 695 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  29.19 
 
 		 695 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  29.19 
 
 		 695 aa  217  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  28.77 
 
 		 695 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  29.49 
 
 		 713 aa  212  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  29.52 
 
 		 695 aa  210  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  27.67 
 
 		 687 aa  207  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  31 
 
 		 639 aa  207  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  29.46 
 
 		 688 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  29.66 
 
 		 693 aa  177  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  33.98 
 
 		 673 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  33.98 
 
 		 673 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  33.98 
 
 		 673 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  32.84 
 
 		 676 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  26.65 
 
 		 727 aa  160  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  30.13 
 
 		 725 aa  160  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  24.47 
 
 		 670 aa  150  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  26.94 
 
 		 744 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.18 
 
 		 679 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  26.16 
 
 		 676 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  27.26 
 
 		 728 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  30.98 
 
 		 676 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  26.39 
 
 		 730 aa  144  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  26.98 
 
 		 731 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  27.11 
 
 		 731 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  28.18 
 
 		 732 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  27.81 
 
 		 731 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  28.91 
 
 		 724 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  28.17 
 
 		 726 aa  137  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  28.26 
 
 		 733 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  28.46 
 
 		 733 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  28.26 
 
 		 733 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  28.26 
 
 		 733 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  28.26 
 
 		 733 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  28.26 
 
 		 733 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.26 
 
 		 733 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  25.97 
 
 		 662 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.26 
 
 		 733 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  28.76 
 
 		 734 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  24.96 
 
 		 711 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  26.85 
 
 		 662 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.88 
 
 		 699 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  25.91 
 
 		 727 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.81 
 
 		 662 aa  124  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  37.23 
 
 		 729 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  27.69 
 
 		 733 aa  122  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  26.03 
 
 		 728 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  24.51 
 
 		 690 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.77 
 
 		 691 aa  120  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.35 
 
 		 690 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  24.19 
 
 		 726 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  36.55 
 
 		 664 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  24.35 
 
 		 690 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  24.35 
 
 		 711 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  34.52 
 
 		 725 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  34.52 
 
 		 725 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  36.04 
 
 		 664 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  34.01 
 
 		 725 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  34.01 
 
 		 725 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  31.41 
 
 		 733 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  31.58 
 
 		 733 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  31.05 
 
 		 734 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.66 
 
 		 739 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  29.07 
 
 		 727 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.25 
 
 		 722 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  33.64 
 
 		 724 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  29.8 
 
 		 736 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>